RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 MAGEA13PA6NCF6 341 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 ERN1O75460 977 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNH1O95259 989 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 UMPSP11172 480 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PTPN6P29350 595 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 GZMMP51124 257 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PNLIPRP1P54315 467 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 HTR4Q13639 388 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 INPP5AQ14642 412 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 MAPKAPK3Q16644 382 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CRTC3Q6UUV7 619 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 MTSS1LQ765P7 747 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PDZD3Q86UT5 571 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 HEATR4Q86WZ0 1026 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 LAS2Q8IYD9 372 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CHPFQ8IZ52 775 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF175Q8N4F7 328 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 ICA1LQ8NDH6 482 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 TRPV3Q8NET8 790 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 OR7G3Q8NG95 312 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM110BQ8TC76 370 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CHTF18Q8WVB6 975 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 BIRC7Q96CA5 298 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 ERLEC1Q96DZ1 483 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 APOLD1Q96LR9 279 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC115Q96NT0 180 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 OR52E6Q96RD3 313 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 LGR4Q9BXB1 951 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 EHD1Q9H4M9 534 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 ITM2CQ9NQX7 267 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 VPS29Q9UBQ0 182 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CIDEBQ9UHD4 219 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB26Q9ULW5 256 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 AP3M1Q9Y2T2 418 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNE2Q9Y6J6 123 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 C5orf42Q9H799 3197 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 KANSL1LA0AUZ9 987 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR19A6NJB7 356 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR89AB7ZAQ6 455 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 SCN2BO60939 215 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 TIPRLO75663 272 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 ETHE1O95571 254 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PCCBP05166 539 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR89BP0CG08 455 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 ERGP11308 486 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 NCK1P16333 377 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 GGT1P19440 569 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 IL10P22301 178 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 S100A3P33764 101 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 TIE1P35590 1138 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 WNT3P56703 355 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 TBPL1P62380 186 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 RAE1P78406 368 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 FOLH1Q04609 750 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM259Q4ZIN3 620 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM196Q5HYL7 178 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 METRNLQ641Q3 311 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 ATG9BQ674R7 924 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 GLYATQ6IB77 296 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 KIAA1211LQ6NV74 962 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRTM4Q86VH4 590 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 AMZ2Q86W34 360 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 IFNEQ86WN2 208 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CALHM3Q86XJ0 350 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 MARVELD2Q8N4S9 558 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 OR52E4Q8NGH9 312 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CLHC1Q8NHS4 586 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 NEIL2Q969S2 332 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 MED8Q96G25 268 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 EGLN2Q96KS0 407 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 TSSK3Q96PN8 268 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 SH3GL1Q99961 368 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 IKZF5Q9H5V7 419 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 COQ10BQ9H8M1 238 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 SGK2Q9HBY8 427 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 SH2B3Q9UQQ2 575 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CKAP5Q14008 2032 aa10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms