RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495188.2

RNF146-208, Transcript of ring finger protein 146, human

TSL 2

Gene RNF146, Length 593 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF146-208	ENST00000495188	FPGT	O14772	594 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	KRT33A	O76009	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	MOCS3	O95396	460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	FYN	P06241	537 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	CD27	P26842	260 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	HUNK	P57058	714 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF558	Q96NG5	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	LPAR4	Q99677	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	MAP3K3	Q99759	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188		A8MXE2	369 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188		H0YAE9	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	ATP6AP2	O75787	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	PRKAR1A	P10644	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	ERCC2	P18074	760 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	CYP2A7	P20853	494 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	DNA2	P51530	1060 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	CLDN15	P56746	228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	CHST3	Q7LGC8	479 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	TEX28	O15482	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	PLOD3	O60568	738 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	TBX10	O75333	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	GSR	P00390	522 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	MYL6B	P14649	208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	HSPA4	P34932	840 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	DLK1	P80370	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	COG2	Q14746	738 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	EXT1	Q16394	746 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188		Q6ZRP5	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	VGLL1	Q99990	258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	NYX	Q9GZU5	481 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	C5AR2	Q9P296	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188		A0A1W2PR80	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CCDC175	P0C221	793 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	HLA-F	P30511	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	HSD17B3	P37058	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	UBASH3A	P57075	661 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CSNK2B	P67870	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	TRIM29	Q14134	588 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	EXT2	Q93063	718 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	PANK4	Q9NVE7	773 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	ATP1B1	P05026	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	UGT1A4	P22310	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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