RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493694.1

TIMMDC1-207, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TIMMDC1, Length 710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-207ENST00000493694 CDC14AQ9UNH5 594 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 HYOU1Q9Y4L1 999 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 HRH3Q9Y5N1 445 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 MAN1A2O60476 641 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 RPN2P04844 631 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 OR56A5P0C7T3 313 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 TMEM253P0C7T8 217 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 C8orf89P0DMQ9 161 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 ERVK-10P10266 1014 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 CD46P15529 392 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 CCR7P32248 378 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 EMP3P54852 163 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 TYRO3Q06418 890 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 LTBQ06643 244 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 SPARCL1Q14515 664 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 ITIH4Q14624 930 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 CEBPEQ15744 281 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 SYT16Q17RD7 645 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 BTBD16Q32M84 506 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 PLAG1Q6DJT9 500 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 CEP128Q6ZU80 1094 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 TMEM178AQ8NBL3 297 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 OR2L3Q8NG85 312 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 CFAP61Q8NHU2 1237 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 ASB5Q8WWX0 329 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 HDAC10Q969S8 669 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 MVB12AQ96EY5 273 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 NPAS2Q99743 824 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 MIPEPQ99797 713 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 TBL1YQ9BQ87 522 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 LIME1Q9H400 295 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 SYNPO2LQ9H987 977 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 SLC39A10Q9ULF5 831 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 CAPN11Q9UMQ6 739 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 HCFC1P51610 2035 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 FAM90A27PA6NNH2 459 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 H0YGG7 62 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 OR1I1O60431 355 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 NEURL1O76050 574 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 ZWINTO95229 277 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 SP1P08047 785 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 CHRNB4P30926 498 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 YBX1P67809 324 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 HSPA14Q0VDF9 509 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 MYBPHQ13203 477 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 PRPSAP1Q14558 356 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 SLC18A3Q16572 532 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 UNC5DQ6UXZ4 953 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 CRLF3Q8IUI8 442 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 OR2A1Q8NGT9 310 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 FAM57AQ8TBR7 257 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 KCNJ16Q9NPI9 418 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 RNF6Q9Y252 685 aa11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
TIMMDC1-207ENST00000493694 ABCA4P78363 2273 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 A0A1W2PPV9 198 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 OR2A25A4D2G3 310 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 KRT87PA6NCN2 255 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 OR51F1A6NGY5 319 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 FOXS1O43638 330 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 GPC4O75487 556 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 ZNF24P17028 368 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 TPH1P17752 444 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 MSNP26038 577 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 PTGER1P34995 402 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 SLC1A1P43005 524 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 ADAM8P78325 824 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 GTF3C1Q12789 2109 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 MEP1AQ16819 746 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 HKDC1Q2TB90 917 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 SLC25A25Q6KCM7 469 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 LRRC8BQ6P9F7 803 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 LANCL3Q6ZV70 420 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 HMGCLL1Q8TB92 370 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 STYXQ8WUJ0 223 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMMDC1-207ENST00000493694 ASZ1Q8WWH4 475 aa11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms