RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 PPFIBP2Q8ND30 876 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 INPP5DQ92835 1189 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 ICE2Q659A1 982 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 GRK7Q8WTQ7 553 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 PLAC1Q9HBJ0 212 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 TAC3Q9UHF0 121 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 BANF1O75531 89 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 IVDP26440 423 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 GABRB3P28472 473 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 EMP3P54852 163 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 NAA25Q14CX7 972 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 TTLL9Q3SXZ7 439 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 MSS51Q4VC12 460 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 CRB2Q5IJ48 1285 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 EFCAB3Q8N7B9 438 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 SLCO2A1Q92959 643 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 OR2A5Q96R48 311 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF304Q9HCX3 659 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 SCN3AQ9NY46 2000 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 CDC23Q9UJX2 597 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 COMMD10Q9Y6G5 202 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 VPS4BO75351 444 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 HSD17B2P37059 387 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 CRYMQ14894 314 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 PRMT9Q6P2P2 845 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 CPNE9Q8IYJ1 553 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 STT3BQ8TCJ2 826 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 CALML6Q8TD86 181 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 SLAMF7Q9NQ25 335 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 VPS4AQ9UN37 437 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 IMPA1P29218 277 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 RELAQ04206 551 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 KLC1Q07866 573 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 Q0VFX4 171 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 PTK6Q13882 451 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 HKDC1Q2TB90 917 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 KCNMB4Q86W47 210 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 IGDCC3Q8IVU1 814 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 OR11G2Q8NGC1 345 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 C19orf60Q96EN9 201 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC68Q9H2F9 335 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 GRPEL1Q9HAV7 217 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 SEMA3GQ9NS98 782 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 PCYOX1Q9UHG3 505 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 TCP11X1B4DZS4 312 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 ZGLP1P0C6A0 271 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 PGAM1P18669 254 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 MUM1Q2TAK8 710 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 Q6ZS92 163 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 FAM167BQ9BTA0 163 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 CSAG2Q9Y5P2 127 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 SCN2AQ99250 2005 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 SMAPO00193 183 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 P2RX6O15547 441 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 ALPPP05187 535 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 ERVK-10P10266 1014 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 IGFL2Q6UWQ7 119 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 LAPTM4BQ86VI4 370 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 CNTN4Q8IWV2 1026 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 CSNK1A1LQ8N752 337 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 AMER3Q8N944 861 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 COL26A1Q96A83 441 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF839A8K0R7 811 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 ZSCAN12O43309 604 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 FOXS1O43638 330 aa26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms