RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 BRINP3Q76B58 766 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 CUZD1Q86UP6 607 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ITFG1Q8TB96 612 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 APH1BQ8WW43 257 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TEX37Q96LM6 180 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 MIOXQ9UGB7 285 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP18Q9UMW8 372 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 H7C2Y5 167 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 APOL3O95236 402 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 LPLP06858 475 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNHG28P0DPA3 235 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAP2K3P46734 347 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNJ3P48549 501 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 NOVP48745 357 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLDN20P56880 219 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHRNB3Q05901 458 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CEP68Q76N32 757 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR142Q7Z601 462 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PROSER1Q86XN7 944 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF135Q8IUD6 432 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 FBXO30Q8TB52 745 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF675Q8TD23 568 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 VNN3Q9NY84 501 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIF25Q9UIL4 384 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ING4Q9UNL4 249 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTPRJQ12913 1337 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC35F4A4IF30 521 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTHP01270 115 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNNC2P02585 160 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 APOC3P02656 99 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ITGB1P05556 798 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TPH1P17752 444 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 NNMTP40261 264 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAN2A2P49641 1150 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 FGL2Q14314 439 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 STX12Q86Y82 276 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SVOPLQ8N434 492 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 AMBNQ9NP70 447 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 BIN3Q9NQY0 253 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MALT1Q9UDY8 824 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 DBX1A6NMT0 343 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 GNGT2O14610 69 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEC22BO75396 215 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 VPS26AO75436 327 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SUPT7LO94864 414 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RLN2P04090 185 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 OGNP20774 298 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CASP2P42575 452 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 HNMTP50135 292 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms