RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 M0QX08 132 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 G6PDP11413 515 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 MNDAP41218 407 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 DSC3Q14574 896 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP13.01□□□□□ -0.333e-6■■□□□ 11.6
HDLBP-241ENST00000487169 GPR68Q15743 365 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 TICAM1Q8IUC6 712 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM130Q8N3G9 435 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 SORCS1Q8WY21 1168 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 COX4I2Q96KJ9 171 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 MRGPRX2Q96LB1 330 aa13.01□□□□□ -0.33
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HDLBP-241ENST00000487169 KCNA7Q96RP8 456 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 MAGEE1Q9HCI5 957 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 TVP23BQ9NYZ1 205 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 GIMAP2Q9UG22 337 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 RNF11Q9Y3C5 154 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 E7ENX8 843 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 PLK4O00444 970 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 OR1I1O60431 355 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 PRKD3O94806 890 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 EBLN1P0CF75 366 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 SLC7A1P30825 629 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 CCKBRP32239 447 aa13.01□□□□□ -0.33
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HDLBP-241ENST00000487169 ETV3P41162 512 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 HERC3Q15034 1050 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 C11orf91Q3C1V1 193 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 MLIPQ5VWP3 458 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 IQCHQ86VS3 1027 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 TTC9BQ8N6N2 239 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 NEK7Q8TDX7 302 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 P2RY13Q9BPV8 354 aa13.01□□□□□ -0.33
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HDLBP-241ENST00000487169 TMLHEQ9NVH6 421 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 HCN3Q9P1Z3 774 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 FZD4Q9ULV1 537 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 IRAK3Q9Y616 596 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 C10orf71Q711Q0 1435 aa13.01□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 NUP98P52948 1817 aa13□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 MAGEB3O15480 346 aa13□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 NOBOXO60393 691 aa13□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 MAFKO60675 156 aa13□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 TBX10O75333 385 aa13□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 CNMDO75829 334 aa13□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 GSK3BP49841 420 aa13□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 UFM1P61960 85 aa13□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 HYAL2Q12891 473 aa13□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
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HDLBP-241ENST00000487169 KRT74Q7RTS7 529 aa13□□□□□ -0.33
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HDLBP-241ENST00000487169 SVOPLQ8N434 492 aa13□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 OR9A1PQ8NGU1 263 aa13□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 GLYATL1Q969I3 302 aa13□□□□□ -0.33
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HDLBP-241ENST00000487169 BTN3A2P78410 334 aa13□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 SCAPQ12770 1279 aa13□□□□□ -0.33
HDLBP-241ENST00000487169 ADGRE1Q14246 886 aa13□□□□□ -0.33
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HDLBP-241ENST00000487169 SLC2A7Q6PXP3 512 aa13□□□□□ -0.33
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HDLBP-241ENST00000487169 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
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HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PP18 115 aa12.99□□□□□ -0.33
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