RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 ARNTP27540 789 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 MAGEA3P43357 314 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 TTPAP49638 278 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ARSFP54793 590 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 TMED2Q15363 201 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 MSS51Q4VC12 460 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 KIRREL2Q6UWL6 708 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 NLRP9Q7RTR0 991 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 PARP9Q8IXQ6 854 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 PRSS58Q8IYP2 241 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 OR4N4Q8N0Y3 316 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ZADH2Q8N4Q0 377 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 FKBP10Q96AY3 582 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 SLC22A18Q96BI1 424 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 MFSD3Q96ES6 412 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 SERPINB12Q96P63 405 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 SELENOSQ9BQE4 189 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 SYBUQ9NX95 663 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 GALPQ9UBC7 116 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ITPR2Q14571 2701 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 A0A0J9YVX5 310 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 E7ESA3 106 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 NIPSNAP2O75323 286 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 AVILO75366 819 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 NDUFS3O75489 264 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 BANF1O75531 89 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 VAPBO95292 243 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ONECUT2O95948 504 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 IGHEP01854 428 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 CD63P08962 238 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 MLNP12872 115 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 FMO4P31512 558 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ARL4CP56559 192 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 SOX8P57073 446 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 CACNA1DQ01668 2161 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 NOTCH2Q04721 2471 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 Q0VFX4 171 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 CBLBQ13191 982 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 GRM7Q14831 915 aa12.07□□□□□ -0.48
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PRAME-212ENST00000485532 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ZNF787Q6DD87 383 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 LRRC8BQ6P9F7 803 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZS92 163 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 OTOAQ7RTW8 1153 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 OTUD6BQ8N6M0 293 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 AMER2Q8N7J2 671 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 OR2A1Q8NGT9 310 aa12.07□□□□□ -0.48
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PRAME-212ENST00000485532 ZNF285Q96NJ3 590 aa12.07□□□□□ -0.48
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PRAME-212ENST00000485532 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ACAT2Q9BWD1 397 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 TXLNGYQ9BZA5 131 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 WDR54Q9H977 334 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 SYNPO2LQ9H987 977 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 GNPTGQ9UJJ9 305 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 FITM1A5D6W6 292 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 CCDC151A5D8V7 595 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ANKUB1A6NFN9 424 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 FFAR3O14843 346 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 GPR42O15529 346 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 LDLRP01130 860 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 ALBP02768 609 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 SARNPP82979 210 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 BBS9Q3SYG4 887 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 TCTE1Q5JU00 501 aa12.06□□□□□ -0.48
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PRAME-212ENST00000485532 CCDC25Q86WR0 208 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 PDIK1LQ8N165 341 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 OR2L3Q8NG85 312 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 OR11G2Q8NGC1 345 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 GSDMBQ8TAX9 411 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 PEX13Q92968 403 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 RAD51AP1Q96B01 352 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 C8orf44Q96CB5 159 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 SIGLEC10Q96LC7 697 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 PANX3Q96QZ0 392 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 PHACTR1Q9C0D0 580 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 SLC26A1Q9H2B4 701 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 SAYSD1Q9NPB0 183 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-212ENST00000485532 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
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