RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	BEST3	Q8N1M1	668 aa		10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	STYX	Q8WUJ0	223 aa		10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	ASB5	Q8WWX0	329 aa		10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	NRGN	Q92686	78 aa		10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	MIPEP	Q99797	713 aa		10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	ZNF559	Q9BR84	538 aa		10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	ASB1	Q9Y576	335 aa		10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		10.03	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	OR2A25	A4D2G3	310 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	PSTPIP1	O43586	416 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	SPOP	O43791	374 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	NRP2	O60462	931 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	GPC4	O75487	556 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	SLCO2B1	O94956	709 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	COMT	P21964	271 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	CCR7	P32248	378 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	CD96	P40200	585 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	EFNA3	P52797	238 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	HSF1	Q00613	529 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	FOLH1	Q04609	750 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	TFF3	Q07654	80 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	MEP1A	Q16819	746 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	SPINK14	Q6IE38	97 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	TTC23L	Q6PF05	361 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	AMER3	Q8N944	861 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	OR2L3	Q8NG85	312 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	NINJ1	Q92982	152 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	LRRC45	Q96CN5	670 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		10.02	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	DNAJC13	O75165	2243 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279		H0YGG7	62 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	OR1I1	O60431	355 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	APOC2	P02655	101 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	GYPC	P04921	128 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	ANXA5	P08758	320 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	FOSL1	P15407	271 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	TPH1	P17752	444 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	PSMA3	P25788	255 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	PSMB5	P28074	263 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	MSX1	P28360	303 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	FOXN2	P32314	431 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	POU6F1	Q14863	301 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	NAA25	Q14CX7	972 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	BTBD16	Q32M84	506 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	BBS12	Q6ZW61	710 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	TTC1	Q99614	292 aa		10.01	□□□□□ -0.81
APTX-222	ENST00000478279	CARD6	Q9BX69	1037 aa		10.01	□□□□□ -0.81

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