RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473584.1

SCP2-208, Transcript of sterol carrier protein 2, human

TSL 2

Gene SCP2, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCP2-208	ENST00000473584	KERA	O60938	352 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	CA6	P23280	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	PIK3R1	P27986	724 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	CTNNB1	P35222	781 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	TMEM270	Q6UE05	265 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	ISCA2	Q86U28	154 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	MAP3K3	Q99759	626 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	ACOT8	O14734	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	SLC22A3	O75751	556 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	GLCE	O94923	617 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	CCKAR	P32238	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	KIAA1024L	P59773	190 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	ARHGAP1	Q07960	439 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	TAF10	Q12962	218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	NPRL3	Q12980	569 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	SUSD4	Q5VX71	490 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	FUT10	Q6P4F1	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	ANKRD46	Q86W74	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	AMER3	Q8N944	861 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	TLE6	Q9H808	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	SPG21	Q9NZD8	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584		A0A0B4J203	849 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	C17orf105	B2RV13	164 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	ZBTB14	O43829	449 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	MT-ND3	P03897	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	SERPING1	P05155	500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	LIF	P15018	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	AMD1	P17707	334 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	CD27	P26842	260 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	GLIPR1	P48060	266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	NT5C2	P49902	561 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	DCAF10	Q5QP82	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	FAM166A	Q6J272	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	CD101	Q93033	1021 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	MARK4	Q96L34	752 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	RNF121	Q9H920	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	CHKB	Q9Y259	395 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCP2-208	ENST00000473584	OLFM2	O95897	454 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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