RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ARHGEF33A8MVX0 844 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 A8MXE2 369 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 GRM8O00222 908 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ZMPSTE24O75844 475 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SOAT2O75908 522 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 OR4E1P0C645 316 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 EPB42P16452 691 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 MPSTP25325 297 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 MSX1P28360 303 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 RPA4Q13156 261 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR17Q13304 367 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 DHCR24Q15392 516 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR19Q15760 415 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 DPYSL2Q16555 572 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 HIF1AQ16665 826 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 PLET1Q6UQ28 207 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SKA3Q8IX90 412 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 KIAA0895Q8NCT3 520 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 PNMA1Q8ND90 353 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 PIGSQ96S52 555 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF559Q9BR84 538 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 THAP2Q9H0W7 228 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 MARK1Q9P0L2 795 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC6A5Q9Y345 797 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM234BA2RU67 622 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 POM121BA6NF01 834 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 H7C1Q1 480 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 AIPO00170 330 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 PIK3R2O00459 728 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SERPINE1P05121 402 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 HCKP08631 526 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ELK4P28324 431 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 CCR7P32248 378 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 GALNSP34059 522 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR3P46089 330 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 PSME3P61289 254 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SKP1P63208 163 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 FOXO1Q12778 655 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 MESDQ14696 234 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC9A5Q14940 896 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 HFEQ30201 348 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 AVPI1Q5T686 147 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SH2D5Q6ZV89 423 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SV2AQ7L0J3 742 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SHFQ7M4L6 423 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 TMC8Q8IU68 726 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF561Q8N587 486 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 PPM1NQ8N819 430 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF511Q8NB15 262 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 ITFG1Q8TB96 612 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 RCN3Q96D15 328 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 CALML4Q96GE6 196 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 SERAC1Q96JX3 654 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-208ENST00000471759 MARK4Q96L34 752 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms