RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 C8GP07360 202 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 HRH2P25021 359 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 OR1D4P47884 311 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 MLLT10P55197 1068 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 OCA2Q04671 838 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 NADK2Q4G0N4 442 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 MSS51Q4VC12 460 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 GALNT16Q8N428 558 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 PPFIBP2Q8ND30 876 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 COL26A1Q96A83 441 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 CERS2Q96G23 380 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 SPSB2Q99619 263 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 PCBD2Q9H0N5 130 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 SEMA3GQ9NS98 782 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 CDC23Q9UJX2 597 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 PLAAQ9Y263 795 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 SEC16AO15027 2179 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 NDC80O14777 642 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 SLC16A5O15375 505 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 NRP2O60462 931 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 AHSGP02765 367 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 CARSP49589 748 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 SP140Q13342 867 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 CSNK1A1LQ8N752 337 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 TM9SF4Q92544 642 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 CABS1Q96KC9 395 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 CCDC138Q96M89 665 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 OR2A5Q96R48 311 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 NDNQ99608 321 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 PARVBQ9HBI1 364 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 CTSFQ9UBX1 484 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 MAU2Q9Y6X3 613 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 VPS4BO75351 444 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 BANF1O75531 89 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 FBLP22087 321 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 GABRB3P28472 473 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 IMPA1P29218 277 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 ELK3P41970 407 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 ARL4CP56559 192 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 FOXL2P58012 376 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 RAPSNQ13702 412 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 HIF1AQ16665 826 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 PAQR3Q6TCH7 311 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 IGFL3Q6UXB1 125 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 ADCK2Q7Z695 626 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 MIEF2Q96C03 454 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 SNF8Q96H20 258 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 C10orf90Q96M02 699 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 TMEM184CQ9NVA4 438 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 VPS4AQ9UN37 437 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 PCSK5Q92824 1860 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 SOCS6O14544 535 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 MED26O95402 600 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 HIST1H2ADP20671 130 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 CCND1P24385 295 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 CDKN2DP55273 166 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 IL2P60568 153 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 DSG2Q14126 1118 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-205ENST00000467594 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms