RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 NPAS2Q99743 824 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 HAUS8Q9BT25 410 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CAAP1Q9H8G2 361 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 EFCAB1Q9HAE3 211 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MUTYHQ9UIF7 546 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ICKQ9UPZ9 632 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 C5orf42Q9H799 3197 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 A0A1W2PR77 199 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PIPSLA2A3N6 862 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 FAM234BA2RU67 622 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 BBIP1A8MTZ0 92 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 C9JVG2 144 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MRASO14807 208 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 NRP2O60462 931 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SEC22BO75396 215 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SLC22A3O75751 556 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TNFP01375 233 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 THEGLP0DJG4 465 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CDH1P12830 882 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ACPPP15309 386 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 JAK1P23458 1154 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CD27P26842 260 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ACTR1BP42025 376 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 RAB28P51157 221 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ACTR1AP61163 376 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 RIPK1Q13546 671 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 RCAN2Q14206 197 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 COQ5Q5HYK3 327 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ADNP2Q6IQ32 1131 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MED27Q6P2C8 311 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 C16orf89Q6UX73 402 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 HACD2Q6Y1H2 254 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 LPCAT2Q7L5N7 544 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 RETREG3Q86VR2 466 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 FAM129CQ86XR2 697 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ULK2Q8IYT8 1036 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 DEFB107AQ8IZN7 70 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PGAM4Q8N0Y7 254 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 RNF175Q8N4F7 328 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 OR7G3Q8NG95 312 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 GPBAR1Q8TDU6 330 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SNX19Q92543 992 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 REPS1Q96D71 796 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 APIPQ96GX9 242 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CLPTM1LQ96KA5 538 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 IER2Q9BTL4 223 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 THTPAQ9BU02 230 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PCBD2Q9H0N5 130 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 XKR8Q9H6D3 395 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PELI2Q9HAT8 420 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 BRF2Q9HAW0 419 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CD320Q9NPF0 282 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 NDE1Q9NXR1 346 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TAC3Q9UHF0 121 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 KLF15Q9UIH9 416 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 INVSQ9Y283 1065 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 NDUFAF1Q9Y375 327 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SIT1Q9Y3P8 196 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.2□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ASPDHA6ND91 283 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 AXIN1O15169 862 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 NDUFS2O75306 463 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ETHE1O95571 254 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 WNT1P04628 370 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 DCNP07585 359 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PCNAP12004 261 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 BCKDHAP12694 445 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 F3P13726 295 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 AMD1P17707 334 aa9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms