RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 NEIL2Q969S2 332 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE2E3Q969T4 207 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR34Q96EX3 536 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 AIF1LQ9BQI0 150 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCG4Q9H172 646 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SEMA6CQ9H3T2 930 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ACTR8Q9H981 624 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ZBTB26Q9HCK0 441 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 MID1IP1Q9NPA3 183 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ACSS2Q9NR19 701 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 KLK4Q9Y5K2 254 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 TLCD2A6NGC4 264 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 E7EQ34 232 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 OR7A17O14581 309 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 CRCPO75575 148 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 RFPL3O75679 317 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 WFS1O76024 890 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 C9P02748 559 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 FGF4P08620 206 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 CDH1P12830 882 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 HGFP14210 728 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPAN8P19075 237 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 EPORP19235 508 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 CDH3P22223 829 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 GRIA3P42263 894 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ACADVLP49748 655 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SH3BP2P78314 561 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 RELAQ04206 551 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAF3Q13114 568 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 E2F2Q14209 437 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 FIGLAQ6QHK4 219 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ADCK2Q7Z695 626 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 GLRX5Q86SX6 157 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 LSMEM2Q8N112 164 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 L3MBTL4Q8NA19 623 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 OR4F6Q8NGB9 312 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 OR4D9Q8NGE8 314 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 AGAP11Q8TF27 550 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 REPS1Q96D71 796 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 MOCOSQ96EN8 888 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 FAR2Q96K12 515 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 C7orf26Q96N11 449 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 TGM7Q96PF1 710 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PLCD4Q9BRC7 762 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 DPH7Q9BTV6 452 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC29A3Q9BZD2 475 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ASXL3Q9C0F0 2248 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1W2PQM1 296 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 TCP11X1B4DZS4 312 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SLCO1B7G3V0H7 640 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 H7BY64 318 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP6CO00743 305 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 AZIN1O14977 448 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ITM2AO43736 263 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 RASSF9O75901 435 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 OR4F21O95013 312 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 CHEK2O96017 543 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 KRT6AP02538 564 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 KRT6BP04259 564 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 CHRNGP07510 517 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 VIMP08670 466 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 JUPP14923 745 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SDHBP21912 280 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 GSTM2P28161 218 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 CCR10P46092 362 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 KRT6CP48668 564 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL14P50914 215 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 HK2P52789 917 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 GYS2P54840 703 aa9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms