RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 LRFN5Q96NI6 719 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4K3Q96R72 315 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 DPH7Q9BTV6 452 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SPNS1Q9H2V7 528 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ACTL8Q9H568 366 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFATQ9P243 1243 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TAC3Q9UHF0 121 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 FEZF1A0PJY2 475 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CDC14CA4D256 554 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 FITM1A5D6W6 292 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TARM1B6A8C7 271 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 H7BY64 318 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 HAT1O14929 419 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBTB14O43829 449 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJB5O75953 348 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GUCA1CO95843 209 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MT-ND3P03897 115 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NPPBP16860 134 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 OR1D4P47884 311 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNC1P48547 511 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 EFNA3P52797 238 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CHAF1BQ13112 559 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CALCOCO2Q13137 446 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NAE1Q13564 534 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 HKDC1Q2TB90 917 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MLIPQ5VWP3 458 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ICE2Q659A1 982 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CPZQ66K79 652 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 C8orf74Q6P047 294 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 AGTRAPQ6RW13 159 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CYS1Q717R9 158 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEC3Q8TD91 643 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SMPDL3AQ92484 453 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 WBP1Q96G27 269 aa6.7□□□□□ -1.34
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RABGEF1-206ENST00000461017 VPS39Q96JC1 886 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2A5Q96R48 311 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MACROD1Q9BQ69 325 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SGPP1Q9BX95 441 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB17Q9H0T7 212 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RHOJQ9H4E5 214 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 FANCEQ9HB96 536 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PARVBQ9HBI1 364 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TCFL5Q9UL49 500 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 C21orf140B9A014 251 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 FFAR3O14843 346 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC16A5O15375 505 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR42O15529 346 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TAPBPO15533 448 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXS1O43638 330 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 KDM1AO60341 852 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PRAMEF4O60810 478 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJB6O75190 326 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PDGFAP04085 211 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ITGB2P05107 769 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 C8GP07360 202 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 UMODP07911 640 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ALAS2P22557 587 aa6.69□□□□□ -1.34
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