RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454561.2

TRBV5-4-201, Transcript of T cell receptor beta variable 5-4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV5-4, Length 544 nt, Biotype TR V gene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-4-201ENST00000454561 POLHQ9Y253 713 aa7.16□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 MYO7BQ6PIF6 2116 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 A0A0J9YVX5 310 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 ESYT3A0FGR9 886 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 CDC14CA4D256 554 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 OR2A25A4D2G3 310 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 FAM159BA6NKW6 160 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 PIAS1O75925 651 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 TSPAN12O95859 305 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 CAPN1P07384 714 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 CCND1P24385 295 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 HRH2P25021 359 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 SPRP35270 261 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 PGGT1BP53609 377 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 AP1S2P56377 157 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 GPX6P59796 221 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 POU4F1Q01851 419 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 NAE1Q13564 534 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 GRM7Q14831 915 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 GRTP1Q5TC63 336 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 C1orf189Q5VU69 101 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 MLIPQ5VWP3 458 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 AGTRAPQ6RW13 159 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 TMEM207Q6UWW9 146 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 TTLL10Q6ZVT0 673 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 SYVN1Q86TM6 617 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 CTAGE3PQ8IX95 158 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 CEP112Q8N8E3 955 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 EXD3Q8N9H8 876 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 PPFIBP2Q8ND30 876 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 PROKR1Q8TCW9 393 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 ATL1Q8WXF7 558 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 ZNF285Q96NJ3 590 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 GBP5Q96PP8 586 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 OLFM1Q99784 485 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 FAM129AQ9BZQ8 928 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 SMYD2Q9NRG4 433 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 STARD5Q9NSY2 213 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 CUTCQ9NTM9 273 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 TMEM184CQ9NVA4 438 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 ARL15Q9NXU5 204 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 ANKMY1Q9P2S6 941 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 TAC3Q9UHF0 121 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 TCFL5Q9UL49 500 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBV5-4-201ENST00000454561 PTPN13Q12923 2485 aa7.15□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 A0A1B0GX78 115 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 HYKKA2RU49 373 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 FITM1A5D6W6 292 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 H0YGG7 62 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 H7BY64 318 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 TXNDC9O14530 226 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 DSCR3O14972 297 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 DNAJC13O75165 2243 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 ONECUT2O95948 504 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 PRB1P04280 392 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 FURINP09958 794 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 FAM87AP0C7U9 286 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 NPPBP16860 134 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 STX2P32856 288 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 GP5P40197 560 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 GCGRP47871 477 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 RPS18P62269 152 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 NAB1Q13506 487 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 NCF4Q15080 339 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 PHKG1Q16816 387 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBV5-4-201ENST00000454561 UGT8Q16880 541 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78 ms