RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SMPDL3BQ92485 455 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PCDHB18PQ96TA0 734 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ATG10Q9H0Y0 220 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 RAB9BQ9NP90 201 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 AGRPO00253 132 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 LCN1P31025 176 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SCNN1AP37088 669 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TNFSF9P41273 254 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GNMTQ14749 295 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 NPTX1Q15818 432 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MOB2Q70IA6 237 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SEC14L1Q92503 715 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PMEPA1Q969W9 287 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SLC32A1Q9H598 525 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PTPRMP28827 1452 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 OR6C70A6NIJ9 312 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 E7EQ34 232 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ITGB1P05556 798 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 NCK1P16333 377 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PRMT2P55345 433 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GNG2P59768 71 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DAG1Q14118 895 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 UTS2BQ765I0 119 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MON1BQ7L1V2 547 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ANKRD46Q86W74 232 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FAM84AQ96KN4 292 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 Q9N2J8 555 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ASB6Q9NWX5 421 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 CLIC1O00299 241 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MFSD11O43934 449 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GP1BBP13224 206 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MOAP1Q96BY2 351 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FEM1AQ9BSK4 669 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 CENPMQ9NSP4 180 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DEPDC5O75140 1603 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 IFNA1P01562 189 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GKN3PP0CG01 181 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 BCKDHAP12694 445 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ACTR1BP42025 376 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TPGS2Q68CL5 300 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GID4Q8IVV7 300 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TMEM234Q8WY98 164 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 CPXM1Q96SM3 734 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 EBPLQ9BY08 206 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 LRRC42Q9Y546 428 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DCCP43146 1447 aa6.52□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 A0A1B0GVI7 797 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PIP5K1BO14986 540 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 BANF1O75531 89 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 RP2O75695 350 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DPP6P42658 865 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MARCKSL1P49006 195 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ACADVLP49748 655 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 LRRC32Q14392 662 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DHCR24Q15392 516 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 OR2T5Q6IEZ7 315 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 LAS2Q8IYD9 372 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms