RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430930.5

TNS1-207, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-207ENST00000430930 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 EI24O14681 340 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 CHRNA1P02708 482 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 RLN2P04090 185 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 S100A6P06703 90 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 LINGO3P0C6S8 592 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 SLC18A2Q05940 514 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 TCEAL1Q15170 157 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 OR2T5Q6IEZ7 315 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 FAM156AQ8NDB6 213 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 OR2T29Q8NH02 315 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 ZNF639Q9UID6 485 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 ALPIP09923 528 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 CRHR2Q13324 411 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 GKN2Q86XP6 184 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 SLC22A15Q8IZD6 547 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 KAT2AQ92830 837 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 ESAMQ96AP7 390 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 CDK15Q96Q40 435 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 ITPAQ9BY32 194 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 FANCFQ9NPI8 374 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 ZNF536O15090 1300 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 OR51F1A6NGY5 319 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 SAP18O00422 153 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 SCDO00767 359 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 RPL19P84098 196 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 PITRM1Q5JRX3 1037 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 DCAF4L2Q8NA75 395 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 THRSPQ92748 146 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 CCSER2Q9H7U1 834 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 MCCC2Q9HCC0 563 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 SNTG1Q9NSN8 517 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 UTS2RQ9UKP6 389 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 ANKRD66B4E2M5 251 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 ITM2AO43736 263 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 AOC1P19801 751 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 CBLBQ13191 982 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 TUBA3CQ13748 450 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 PDSS1Q5T2R2 415 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 SLC9B2Q86UD5 537 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 COL21A1Q96P44 957 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 TRIB3Q96RU7 358 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 ADAP2Q9NPF8 381 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 TEX264Q9Y6I9 313 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 A0A1W2PQY0 241 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 PEX10O60683 326 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 FMO3P31513 532 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 DSC3Q14574 896 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 KLHL6Q8WZ60 621 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 GMEB1Q9Y692 573 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 WASF2Q9Y6W5 498 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 SNED1Q8TER0 1413 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 LCHNA4D1U4 455 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 C9IYK1 514 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 PLOD2O00469 737 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 ACOX3O15254 700 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 ERI3O43414 337 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 TGFB1P01137 390 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 GDI1P31150 447 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 GJA9P57773 515 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 ULK3Q6PHR2 472 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 PROKR2Q8NFJ6 384 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 KIAA1191Q96A73 305 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 PYURFQ96I23 114 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 UCK2Q9BZX2 261 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 ACTR3BQ9P1U1 418 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 H0YGN5 161 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 PRAMEF11O60813 436 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 SNAPC5O75971 98 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 CD36P16671 472 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 WDR4P57081 412 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 ST3GAL3Q11203 375 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 LRRC73Q5JTD7 316 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 IQCHQ86VS3 1027 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
TNS1-207ENST00000430930 OR6K6Q8NGW6 343 aa12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms