RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 KLHL18O94889 574 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 METTL18O95568 372 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ONECUT2O95948 504 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ALPPP05187 535 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 MAGP20916 626 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 MMP11P24347 488 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 PSMA3P25788 255 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ITGA3P26006 1051 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 SHMT2P34897 504 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 GRB7Q14451 532 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 NKG7Q16617 165 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 CYP2A13Q16696 494 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 FCRL6Q6DN72 434 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 VRK3Q8IV63 474 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 VSTM4Q8IW00 320 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 DNAJB14Q8TBM8 379 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 HEXDCQ8WVB3 486 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 FAR1Q8WVX9 515 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 SPATA13Q96N96 652 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 IL17FQ96PD4 163 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 CTSFQ9UBX1 484 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 PLCL2Q9UPR0 1127 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ASF1AQ9Y294 204 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 KRT87PA6NCN2 255 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ISM1B1AKI9 464 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 PJA2O43164 708 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 OR1I1O60431 355 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 NRP2O60462 931 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ICMTO60725 284 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 WISP2O76076 250 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 AP2A2O94973 939 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 AP2A1O95782 977 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 IGHEP01854 428 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 RBP3P10745 1247 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 PKLRP30613 574 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 FOXN2P32314 431 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 GRIA3P42263 894 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 OR1D4P47884 311 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 SERPINB4P48594 390 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 TDGF1P3P51864 188 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 CACNG1Q06432 222 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM14Q14142 442 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 POU6F1Q14863 301 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 HOOK3Q86VS8 718 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 SLC34A3Q8N130 599 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 OR5K2Q8NHB8 316 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 TM9SF4Q92544 642 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ELMO1Q92556 727 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 CNDP1Q96KN2 507 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 SLX1AQ9BQ83 275 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 NDC1Q9BTX1 674 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 OR6C2Q9NZP2 312 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 CDC23Q9UJX2 597 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 FBN2P35556 2912 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1B0GX78 115 aa6.25□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.25□□□□□ -1.41
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