RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 C14orf28Q4W4Y0 310 aa22.43■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 LIPJQ5W064 366 aa22.43■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 ATG9BQ674R7 924 aa22.43■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 IL27RAQ6UWB1 636 aa22.43■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 ZNF438Q7Z4V0 828 aa22.43■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 RABEPKQ7Z6M1 372 aa22.43■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 SLC35F3Q8IY50 421 aa22.43■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 ANKS4BQ8N8V4 417 aa22.43■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 OR2T11Q8NH01 316 aa22.43■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.43■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 KLHL20Q9Y2M5 609 aa22.43■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa22.43■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 TRPC5OSA6NMA1 111 aa22.42■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 ISM1B1AKI9 464 aa22.42■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 H7BY64 318 aa22.42■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 TRIM38O00635 465 aa22.42■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 UGDHO60701 494 aa22.42■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 TYRP1P17643 537 aa22.42■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 DPP6P42658 865 aa22.42■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 WDR34Q96EX3 536 aa22.42■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 LOXL4Q96JB6 756 aa22.42■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 PRAP1Q96NZ9 151 aa22.42■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.42■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 PCBD2Q9H0N5 130 aa22.42■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
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CNN3-202ENST00000394202 TBCCQ15814 346 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 KIRREL3Q8IZU9 778 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 OR2L3Q8NG85 312 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 PPM1MQ96MI6 270 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 SLC29A3Q9BZD2 475 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 TCF7L2Q9NQB0 619 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 PIPSLA2A3N6 862 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 E9PBE3 544 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 KLHL41O60662 606 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 PDYNP01213 254 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 PPP1CAP62136 330 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 TMEM198Q66K66 360 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 GRHL2Q6ISB3 625 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 Q6ZSR9 355 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 FAM129CQ86XR2 697 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 RSC1A1Q92681 617 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 SLC6A20Q9NP91 592 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 RNF215Q9Y6U7 377 aa22.41■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 ULK1O75385 1050 aa22.4■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 CHEK2O96017 543 aa22.4■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 TCF15Q12870 199 aa22.4■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 XKR7Q5GH72 579 aa22.4■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 NXNQ6DKJ4 435 aa22.4■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 TRIM73Q86UV7 250 aa22.4■■□□□ 1.18
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CNN3-202ENST00000394202 OR2A14Q96R47 310 aa22.4■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 EHD1Q9H4M9 534 aa22.4■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 AKTIPQ9H8T0 292 aa22.4■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 HRASLS2Q9NWW9 162 aa22.4■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 CCL27Q9Y4X3 112 aa22.4■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 GSAPA4D1B5 854 aa22.39■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 ENGP17813 658 aa22.39■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 HNF4AP41235 474 aa22.39■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 PLA2G2CQ5R387 149 aa22.39■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 FRG2Q64ET8 278 aa22.39■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 ARL10Q8N8L6 244 aa22.39■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 OR7G3Q8NG95 312 aa22.39■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 WDR20Q8TBZ3 569 aa22.39■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 FRG2BQ96QU4 278 aa22.39■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 ACTR10Q9NZ32 417 aa22.39■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 RAB23Q9ULC3 237 aa22.39■■□□□ 1.18
CNN3-202ENST00000394202 H0YIV9 168 aa22.39■■□□□ 1.17
CNN3-202ENST00000394202 UGT2B7P16662 529 aa22.39■■□□□ 1.17
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CNN3-202ENST00000394202 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
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CNN3-202ENST00000394202 ELOVL6Q9H5J4 265 aa22.39■■□□□ 1.17
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CNN3-202ENST00000394202 LRIT1Q9P2V4 623 aa22.39■■□□□ 1.17
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CNN3-202ENST00000394202 HMGCS1Q01581 520 aa22.38■■□□□ 1.17
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