RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF225Q9UK10 706 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FBXL2Q9UKC9 423 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRDM4Q9UKN5 801 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DOCK6Q96HP0 2047 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR5K3A6NET4 321 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 A8MWP4 228 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C2CD4DB7Z1M9 353 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC24A1O60721 1099 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LCA5LO95447 670 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SEC24AO95486 1093 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 VIL1P09327 827 aaKnown RBP-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NUDT17P0C025 328 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PPIAL4GP0DN37 164 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IRF1P10914 325 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IL1R1P14778 569 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BDKRB2P30411 391 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HTR7P34969 479 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FASLGP48023 281 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LHX2P50458 406 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SMARCB1Q12824 385 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BIRC3Q13489 604 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IL10RAQ13651 578 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UPP1Q16831 310 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZACNQ401N2 412 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DEFB134Q4QY38 66 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CTRB2Q6GPI1 263 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF280DQ6N043 979 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BRAT1Q6PJG6 821 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IL34Q6ZMJ4 242 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMPPEQ6ZT21 453 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ADM2Q7Z4H4 148 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C11orf74Q86VG3 221 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SESTD1Q86VW0 696 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KIRREL3Q8IZU9 778 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 THEM5Q8N1Q8 247 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GDPD5Q8WTR4 605 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DNAAF4Q8WXU2 420 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CASD1Q96PB1 797 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC22A12Q96S37 553 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARID3AQ99856 593 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAIM2Q9BWQ8 316 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZHX3Q9H4I2 956 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF702PQ9H963 129 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MED4Q9NPJ6 270 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARMCX1Q9P291 453 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DNPEPQ9ULA0 475 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ASB3Q9Y575 518 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRR14LQ5THK1 2151 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPTBN4Q9H254 2564 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LRRD1A4D1F6 860 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GRIFINA4D1Z8 144 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C5orf63A6NC05 138 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR6C76A6NM76 312 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 H0YAE9 185 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RRP9O43818 475 aaKnown RBP-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DDAH2O95865 285 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ALPIP09923 528 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 VPREB1P12018 145 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DRD1P21728 446 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HOXD10P28358 340 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PKLRP30613 574 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPRR2BP35325 72 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MAGEA9P43362 315 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRIM2P49643 509 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCR3P51677 355 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CDH11P55287 796 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NUP107P57740 925 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GALK2Q01415 458 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C17orf67Q0P5P2 114 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CD226Q15762 336 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PAGE2BQ5JRK9 111 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM255AQ5JRV8 349 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM209AQ5JX71 171 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZFAND6Q6FIF0 208 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TLDC1Q6P9B6 456 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RAD9BQ6WBX8 426 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GALNT7Q86SF2 657 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GPR180Q86V85 440 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF677Q86XU0 584 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FOXRED2Q8IWF2 684 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GCNT2Q8N0V5 402 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CARNMT1Q8N4J0 409 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DNAAF1Q8NEP3 725 aa-2.29□□□□□ -2.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms