RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNA2P51530 1060 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 OLR1P78380 273 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TFAP4Q01664 338 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 LMOD3Q0VAK6 560 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTPN14Q15678 1187 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPR68Q15743 365 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ODF4Q2M2E3 257 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 DPCR1Q3MIW9 517 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANO1Q5XXA6 986 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 EMBQ6PCB8 327 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPAINQ86UA6 219 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CNTROBQ8N137 903 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF175Q8N4F7 328 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 AVL9Q8NBF6 648 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM116Q8NCL8 245 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC107Q8WV48 283 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SGCDQ92629 289 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 IL22RA2Q969J5 263 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 C11orf52Q96A22 123 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLCO4A1Q96BD0 722 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM149B1Q96BN6 582 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 HDAC11Q96DB2 347 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 IMMP1LQ96LU5 166 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAGEB18Q96M61 343 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM20AQ96MK3 541 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 DACH2Q96NX9 599 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 GAD1Q99259 594 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 OLFM1Q99784 485 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF670Q9BS34 389 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 DPAGT1Q9H3H5 408 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNAJC18Q9H819 358 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MOB1AQ9H8S9 216 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLEKHA3Q9HB20 300 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLCB1Q9NQ66 1216 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITM2CQ9NQX7 267 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SETD4Q9NVD3 440 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITGA11Q9UKX5 1188 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM17Q9Y577 477 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SELENOKQ9Y6D0 94 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZFP92A6NM28 416 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 SERPINE3A8MV23 424 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 A8MV72 311 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 F8VVB4 439 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 F8VWA3 439 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF749O43361 778 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 SSX4O60224 188 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 B4GALT2O60909 372 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 CA11O75493 328 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEC14L2O76054 403 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 F9P00740 461 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIGRP01833 764 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP1B1P05026 303 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRT18P05783 430 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 HCKP08631 526 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADORA3P0DMS8 318 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPS2P15880 293 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 JAK1P23458 1154 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 GDF1P27539 372 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 MDH2P40926 338 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 HARS2P49590 506 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 SUOXP51687 545 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 RIDAP52758 137 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 RARSP54136 660 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 GALCP54803 685 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARL4CP56559 192 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERVK-16P61578 105 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 GNB2P62879 340 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYL7Q01449 175 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM29Q14134 588 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIAA0040Q15053 153 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 CA9Q16790 459 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 GSG1Q2KHT4 349 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCGF3Q3KNV8 242 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 ALDH1L2Q3SY69 923 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPR33Q49SQ1 333 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM69AQ5T7M9 428 aa0.21□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.8 ms