RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C2orf81A6NN90 581 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 E7ESA3 106 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AGPSO00116 658 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AP3B1O00203 1094 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLK4O00444 970 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UGT1A9O60656 530 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FGF1P05230 155 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HLA-DPA1P20036 260 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADRA1DP25100 572 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STX2P32856 288 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AP1S1P61966 158 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP1A4Q13733 1029 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDKL2Q92772 493 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AGAP2Q99490 1192 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPR35Q9HC97 309 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DYRK4Q9NR20 520 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VPS18Q9P253 973 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IL36AQ9UHA7 158 aa6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HELZP42694 1942 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SDK1Q7Z5N4 2213 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAGEB16A2A368 324 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 URADA6NGE7 173 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 H3BQF6 201 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GOLGA8RI6L899 631 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP8B1O43520 1251 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VPS4BO75351 444 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 E2F6O75461 281 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CR2P20023 1033 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PSMD8P48556 350 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAD23AP54725 363 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BMPR2Q13873 1038 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPA1Q15181 289 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TREML4Q6UXN2 200 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PACS1Q6VY07 963 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNMB4Q86W47 210 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRRC6Q86X45 466 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PAFAH2Q99487 392 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NAT9Q9BTE0 207 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NDC1Q9BTX1 674 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KLHL4Q9C0H6 718 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PKP3Q9Y446 797 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM47DPA6NHR8 397 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANHXE9PGG2 379 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPAG6O75602 509 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PIAS2O75928 621 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PGLSO95336 258 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLDN7O95471 211 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EGFP01133 1207 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC5A2P31639 672 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAGEA3P43357 314 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HK2P52789 917 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 METAP1P53582 386 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRR5P85299 388 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDE1BQ01064 536 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NFE2L1Q14494 772 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms