RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343217.6

DUSP28-201, Transcript of dual specificity phosphatase 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene DUSP28, Length 1,555 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28-201ENST00000343217 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
DUSP28-201ENST00000343217 GRB7Q14451 532 aa20.15■□□□□ 0.82
DUSP28-201ENST00000343217 L3MBTL4Q8NA19 623 aa20.15■□□□□ 0.82
DUSP28-201ENST00000343217 MIPEPQ99797 713 aa20.15■□□□□ 0.82
DUSP28-201ENST00000343217 SGPP1Q9BX95 441 aa20.15■□□□□ 0.82
DUSP28-201ENST00000343217 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa20.15■□□□□ 0.82
DUSP28-201ENST00000343217 TMEM168Q9H0V1 697 aa20.15■□□□□ 0.82
DUSP28-201ENST00000343217 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.15■□□□□ 0.82
DUSP28-201ENST00000343217 FTSJ1Q9UET6 329 aa20.15■□□□□ 0.82
DUSP28-201ENST00000343217 KCNE2Q9Y6J6 123 aa20.15■□□□□ 0.82
DUSP28-201ENST00000343217 NDUFS1P28331 727 aa20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 TBPL1P62380 186 aa20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 LIPJQ5W064 366 aa20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 PARGQ86W56 976 aa20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 FERD3LQ96RJ6 166 aa20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 TUBB1Q9H4B7 451 aa20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 PRDM8Q9NQV8 689 aa20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 RIC8BQ9NVN3 520 aa20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.14■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 CLGNO14967 610 aa20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 SLC22A2O15244 555 aa20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 KRT6AP02538 564 aa20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 KRT6BP04259 564 aa20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 GNAZP19086 355 aa20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 ACTR1BP42025 376 aa20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 KRT6CP48668 564 aa20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 ACTR1AP61163 376 aa20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 FZD2Q14332 565 aa20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 KRT33BQ14525 404 aa20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 CLCA4Q14CN2 919 aa20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 CCDC106Q9BWC9 280 aa20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 GSDMCQ9BYG8 508 aa20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 CIDEBQ9UHD4 219 aa20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 SLC12A4Q9UP95 1085 aa20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 RNF11Q9Y3C5 154 aa20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 FAM208BQ5VWN6 2430 aa20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 ULK1O75385 1050 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 IRF8Q02556 426 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 BNIP3Q12983 259 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 PRKG2Q13237 762 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 RPE65Q16518 533 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 CYP2A13Q16696 494 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 XKR7Q5GH72 579 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 CHSY3Q70JA7 882 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 GPBAR1Q8TDU6 330 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 C3orf30Q96M34 536 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 PCBD2Q9H0N5 130 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 TBC1D29Q9UFV1 150 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 SNX6Q9UNH7 406 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 BTRCQ9Y297 605 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 DYRK1BQ9Y463 629 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 ACACAQ13085 2346 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 CAPN14A8MX76 684 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 TAF4O00268 1085 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 WFS1O76024 890 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 UNC5CO95185 931 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 LINC00032P0C843 101 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 AK4P27144 223 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 HNF4AP41235 474 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF33BQ06732 778 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 CHIT1Q13231 466 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 LCTLQ6UWM7 567 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 TUBGCP3Q96CW5 907 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 OR4K3Q96R72 315 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 HAUS8Q9BT25 410 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 AKTIPQ9H8T0 292 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 ARMCX1Q9P291 453 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 CAPN7Q9Y6W3 813 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 LAMA5O15230 3695 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 SCAMP1O15126 338 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 UBDO15205 165 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 F3P13726 295 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 JUPP14923 745 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 LBPP18428 481 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 CASP2P42575 452 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP28-201ENST00000343217 RASSF2P50749 326 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms