RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 WDR60Q8WVS4 1066 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ROPN1LQ96C74 230 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 REPS1Q96D71 796 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SLC45A3Q96JT2 553 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 NRTNQ99748 197 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 LRP4O75096 1905 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 A0A1W2PP18 115 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 DYTNA2CJ06 578 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 C9JVG2 144 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 AMD1P17707 334 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 DPP6P42658 865 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 KCNK10P57789 538 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 LAPTM5Q13571 262 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 FAM129CQ86XR2 697 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CCL4L1Q8NHW4 92 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 APIPQ96GX9 242 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MAP10Q9P2G4 905 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PIPSLA2A3N6 862 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 RASGRP1O95267 797 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 EML2O95834 649 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 BCKDHAP12694 445 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ACTR1BP42025 376 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ACTR1AP61163 376 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MTAPQ13126 283 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 C17orf64Q86WR6 236 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 NRROSQ86YC3 692 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 HID1Q8IV36 788 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 RNF175Q8N4F7 328 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CADM4Q8NFZ8 388 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 THEGQ9P2T0 379 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TAC3Q9UHF0 121 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ASPDHA6ND91 283 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 METTL12A8MUP2 240 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ANGPT2O15123 496 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CIB2O75838 187 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TNFP01375 233 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 THEGLP0DJG4 465 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PRPS2P11908 318 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CDH1P12830 882 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 NDUFS1P28331 727 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PXNP49023 591 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 FZD2Q14332 565 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PTGR1Q14914 329 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TLR1Q15399 786 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PIGGQ5H8A4 983 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 LIX1Q8N485 282 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 GPBAR1Q8TDU6 330 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 UBE2E3Q969T4 207 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CDRT15Q96T59 188 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SERPINI1Q99574 410 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PELI2Q9HAT8 420 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ICKQ9UPZ9 632 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 COL6A3P12111 3177 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 COQ9O75208 318 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ENTPD5O75356 428 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PDE5AO76074 875 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 F3P13726 295 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CD27P26842 260 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MAPK1P28482 360 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PSME3P61289 254 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 KRT33BQ14525 404 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.8 ms