RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 LYPD8Q6UX82 237 aa18.77■□□□□ 0.6
NOP56-201ENST00000329276 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
NOP56-201ENST00000329276 DEPDC4Q8N2C3 294 aa18.77■□□□□ 0.6
NOP56-201ENST00000329276 CITED4Q96RK1 184 aa18.77■□□□□ 0.6
NOP56-201ENST00000329276 KCNS3Q9BQ31 491 aa18.77■□□□□ 0.6
NOP56-201ENST00000329276 WDR70Q9NW82 654 aa18.77■□□□□ 0.6
NOP56-201ENST00000329276 SIRT5Q9NXA8 310 aa18.77■□□□□ 0.6
NOP56-201ENST00000329276 KCNN3Q9UGI6 736 aa18.77■□□□□ 0.6
NOP56-201ENST00000329276 SNX7Q9UNH6 387 aa18.77■□□□□ 0.6
NOP56-201ENST00000329276 KLHL20Q9Y2M5 609 aa18.77■□□□□ 0.6
NOP56-201ENST00000329276 EFCAB10A6NFE3 127 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 STX7O15400 261 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ULK1O75385 1050 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 DIRAS1O95057 198 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ALPPP05187 535 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 CCNJQ5T5M9 372 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 GPR153Q6NV75 609 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 SUSD1Q6UWL2 747 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ZNF605Q86T29 641 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 GPC2Q8N158 579 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 TTPALQ9BTX7 342 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 MROH8Q9H579 483 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ZMYM5Q9UJ78 669 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 V9GYH0 126 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 A0A0G2JMP0 313 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 STSP08842 583 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 PIRTP0C851 137 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 CLDN8P56748 225 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 FAM171BQ6P995 826 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ZNF767PQ75MW2 155 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 CBLL1Q75N03 491 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ZZZ3Q8IYH5 903 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ZNF683Q8IZ20 524 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 SNX8Q9Y5X2 465 aa18.76■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 E5RI56 91 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ARHGEF15O94989 841 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 VIPP01282 170 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 KDELR2P33947 212 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 IL12RB1P42701 662 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ST3GAL4Q11206 333 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 VMACQ2NL98 169 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 CDONQ4KMG0 1287 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 CTSL3PQ5NE16 218 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 C9orf131Q5VYM1 1079 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 RDH10Q8IZV5 341 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 VWA5B2Q8N398 1253 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 OR4K2Q8NGD2 314 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 SCAMP5Q8TAC9 235 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 CDCA4Q9BXL8 241 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 GPR83Q9NYM4 423 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 KLHL21Q9UJP4 597 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ESR1P03372 595 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 BCKDHAP12694 445 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ZNF235Q14590 738 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 DOK6Q6PKX4 331 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 IDO2Q6ZQW0 420 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 OR5H6Q8NGV6 325 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 NACC2Q96BF6 587 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 HSH2DQ96JZ2 352 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ROGDIQ9GZN7 287 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 SRRQ9GZT4 340 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 MOSPD1Q9UJG1 213 aa18.75■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 HSMCR30P0CW71 290 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 HLA-DMAP28067 261 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 RPS14P62263 151 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 HMGCS1Q01581 520 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 FAPQ12884 760 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ABRQ12979 859 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 VGLL4Q14135 290 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ATCAYQ86WG3 371 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 EFHBQ8N7U6 833 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 TRIB3Q96RU7 358 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ACBD6Q9BR61 282 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 TXNRD2Q9NNW7 524 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 AMBNQ9NP70 447 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 MUTYHQ9UIF7 546 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 DNMT3LQ9UJW3 386 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 TLR6Q9Y2C9 796 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 SPEF1Q9Y4P9 236 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 C2orf81A6NN90 581 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 RGS5O15539 181 aa18.74■□□□□ 0.59
NOP56-201ENST00000329276 FFAR2O15552 330 aa18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms