RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 TMED2Q15363 201 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPKAPK3Q16644 382 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 MFSD4BQ5TF39 518 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 UNC5DQ6UXZ4 953 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 CD163Q86VB7 1156 aa7.46□□□□□ -1.22
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PGGT1B-201ENST00000296642 OR2L8Q8NGY9 312 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ASZ1Q8WWH4 475 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 RAPGEF5Q92565 580 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 RAD51AP1Q96B01 352 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 MBD6Q96DN6 1003 aa7.46□□□□□ -1.22
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PGGT1B-201ENST00000296642 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 DLL4Q9NR61 685 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 LRFN1Q9P244 771 aa7.46□□□□□ -1.22
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PGGT1B-201ENST00000296642 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
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PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0J9YVX5 310 aa7.45□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 NKX2-6A6NCS4 301 aa7.45□□□□□ -1.22
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PGGT1B-201ENST00000296642 CTAG2O75638 210 aa7.45□□□□□ -1.22
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PGGT1B-201ENST00000296642 APOA4P06727 396 aa7.45□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 HEXAP06865 529 aa7.45□□□□□ -1.22
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PGGT1B-201ENST00000296642 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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PGGT1B-201ENST00000296642 CYB561P49447 251 aa7.45□□□□□ -1.22
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PGGT1B-201ENST00000296642 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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PGGT1B-201ENST00000296642 LPAR4Q99677 370 aa7.45□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM51Q9BSJ1 452 aa7.45□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM121Q9BTD3 319 aa7.45□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 DRC3Q9H069 523 aa7.45□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM96AQ9H5X1 160 aa7.45□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.45□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 PLAGL1Q9UM63 463 aa7.45□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL20Q9Y2M5 609 aa7.45□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCA4P78363 2273 aa7.45□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 AKAP9Q99996 3911 aa7.45□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC5A10A0PJK1 596 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF839A8K0R7 811 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 GABRR3A8MPY1 467 aa7.44□□□□□ -1.22
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PGGT1B-201ENST00000296642 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A12O75746 678 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 GOSR1O95249 250 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNDBP1O95273 360 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 AGTP01019 485 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 RAF1P04049 648 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC26A3P40879 764 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNFP41002 786 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC1A1P43005 524 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 KIR2DL3P43628 341 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R40P59535 323 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPA14Q0VDF9 509 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 WASHC5Q12768 1159 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 PTK6Q13882 451 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM53BQ14153 422 aa7.44□□□□□ -1.22
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