RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 MTX3Q5HYI7 312 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF220Q5VTB9 566 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT80Q6KB66 452 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 OGFOD2Q6N063 350 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 DENND1CQ8IV53 801 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A45Q8N413 288 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PGBD5Q8N414 524 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CARNMT1Q8N4J0 409 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 AADATQ8N5Z0 425 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIB3Q96RU7 358 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ATOH8Q96SQ7 321 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PKP2Q99959 881 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCG4Q9H172 646 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 MUC3BQ9H195 1237 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CD274Q9NZQ7 290 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CD300AQ9UGN4 299 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 POLG2Q9UHN1 485 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ARL5AQ9Y689 179 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM234BA2RU67 622 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC72A6NJI9 287 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 H7C0S8 307 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 BTN3A1O00481 513 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PIP5K1BO14986 540 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 RAD51BO15315 384 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFSF15O95150 251 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CYBBP04839 570 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 HGFP14210 728 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CHRM3P20309 590 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 MSH3P20585 1137 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 FASP25445 335 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 GSTT1P30711 240 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 MC4RP32245 332 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC7A2P52569 658 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 NR1H2P55055 460 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 AP1S1P61966 158 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ERVK-8P63133 956 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP4F2P78329 520 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 MS4A2Q01362 244 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CACNG1Q06432 222 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CLCA4Q14CN2 919 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TLR1Q15399 786 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4D1Q15615 310 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SMU1Q2TAY7 513 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TBCELQ5QJ74 424 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ADGRF1Q5T601 910 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CLEC6AQ6EIG7 209 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC23LQ6PF05 361 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PAOXQ6QHF9 649 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa6.84□□□□□ -1.31
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