RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 SOCS7O14512 581 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 C9P02748 559 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 S100GP29377 79 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 TIE1P35590 1138 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 DSC3Q14574 896 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 MARCH8Q5T0T0 291 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 AGTRAPQ6RW13 159 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 CDH24Q86UP0 819 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 AVL9Q8NBF6 648 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 TRPV1Q8NER1 839 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 IGSF21Q96ID5 467 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 PSKH2Q96QS6 385 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 SLC35A5Q9BS91 424 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 TLR9Q9NR96 1032 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 TVP23BQ9NYZ1 205 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 CDC14AQ9UNH5 594 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 DGKBQ9Y6T7 804 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 INPPL1O15357 1258 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 IL4RP24394 825 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 IL12BP29460 328 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 DGKQP52824 942 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 IL18R1Q13478 541 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 LCN1P1Q5VSP4 162 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 OR4F3Q6IEY1 312 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF783Q6ZMS7 281 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 FRRS1Q6ZNA5 592 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 KCTD8Q6ZWB6 473 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 MCEMP1Q8IX19 187 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF366Q8N895 744 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 CAMKVQ8NCB2 501 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 OR10G2Q8NGC3 310 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 RIT1Q92963 219 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 GORASP1Q9BQQ3 440 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 C11orf16Q9NQ32 467 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 P2RX2Q9UBL9 471 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 ERI3O43414 337 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 HMGN1P05114 100 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 ENGP17813 658 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 GMFBP60983 142 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 ABHD18Q0P651 414 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 IL18Q14116 193 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 UBXN2BQ14CS0 331 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 PLEKHG6Q3KR16 790 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 LY6G5CQ5SRR4 150 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 GPRC6AQ5T6X5 926 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 NXPE1Q8N323 547 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 GPER1Q99527 375 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 ACTR3BQ9P1U1 418 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 FZD4Q9ULV1 537 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 URB1O60287 2271 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 CLDN25C9JDP6 229 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 MANBAO00462 879 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 IFNA6P05013 189 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 SCAPQ12770 1279 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 SP140Q13342 867 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 NRSN1Q8IZ57 195 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 MEIOBQ8N635 442 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 TSTD1Q8NFU3 115 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 FAM110BQ8TC76 370 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 RTP4Q96DX8 246 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 RNF31Q96EP0 1072 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 GPR62Q9BZJ7 368 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 ZBTB26Q9HCK0 441 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 B4GALT6Q9UBX8 382 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 DHRS7Q9Y394 339 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 E7ENX8 843 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 NOBOXO60393 691 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 PRKD3O94806 890 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 DNAJB13P59910 316 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 TGFBIQ15582 683 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 CRB2Q5IJ48 1285 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM145Q8NBT3 493 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 NEK7Q8TDX7 302 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 ABCB9Q9NP78 766 aa11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms