RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPP3CCP48454 512 aa20.61■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 IRF3Q14653 427 aa20.61■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZMAT1Q5H9K5 638 aa20.61■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 C17orf50Q8WW18 174 aa20.61■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 TTYH2Q9BSA4 534 aa20.61■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 DRGXA6NNA5 263 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 ENGP17813 658 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 BCL7AQ4VC05 210 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATG9BQ674R7 924 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLPP6Q8IY26 295 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR8H2Q8N162 312 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 TP53INP1Q96A56 240 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 SH3GL1Q99961 368 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 EHD3Q9NZN3 535 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 DHRS7Q9Y394 339 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 KEAP1Q14145 624 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 UBE2J2Q8N2K1 259 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 PEX13Q92968 403 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAGIXQ9H6Y5 334 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM8A1Q9UBU6 413 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 NLRC5Q86WI3 1866 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 GFRA2O00451 464 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR1E2P47887 323 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 TUSC3Q13454 348 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNA10Q16322 511 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATAD3CQ5T2N8 411 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRRC66Q68CR7 880 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 SERPINA9Q86WD7 417 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 SELENOMQ8WWX9 145 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR63Q9BZJ6 419 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 TM6SF2Q9BZW4 377 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 MMP27Q9H306 513 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 F5H5T6 163 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 IRF1P10914 325 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 FPR1P21462 350 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 S100A5P33763 92 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAGEA2P43356 314 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR1G1P47890 313 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 TAB1Q15750 504 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMC5Q6UXY8 1006 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 DENND1CQ8IV53 801 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 IL17RDQ8NFM7 739 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 GGHQ92820 318 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 PSKH2Q96QS6 385 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 TM9SF3Q9HD45 589 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 TAF4O00268 1085 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 YY2O15391 372 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 KRT8P05787 483 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 SDC1P18827 310 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 NRARPQ7Z6K4 114 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 SUSD3Q96L08 255 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR5M11Q96RB7 305 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 PANX1Q96RD7 426 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 CD244Q9BZW8 370 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 NUAK2Q9H093 628 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 P2RY12Q9H244 342 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 REEP1Q9H902 201 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLDN24A6NM45 220 aa20.58■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 CXCR2P25025 360 aa20.58■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 RRM2P31350 389 aa20.58■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF181Q2M3W8 571 aa20.58■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRRG3Q9BZD7 231 aa20.58■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 GKN1Q9NS71 199 aa20.58■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa20.58■□□□□ 0.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLIC1O00299 241 aa20.58■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYBAP13498 195 aa20.58■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR2B6P58173 313 aa20.58■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARMCX4Q5H9R4 360 aa20.58■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF675Q8TD23 568 aa20.58■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLPBQ9H078 707 aa20.58■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNH6Q9H252 994 aa20.58■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 PDZK1P1A8MUH7 402 aa20.57■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 H3BM21 787 aa20.57■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRAMEF1O95521 474 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms