RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239367.6

LRP11-201, Transcript of LDL receptor related protein 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP11, Length 3,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP11-201ENST00000239367 CDK10Q15131 360 aa15.95■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 CCL15Q16663 113 aa15.95■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 TSTQ16762 297 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 FAM110CQ1W6H9 321 aa15.95■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 C11orf74Q86VG3 221 aa15.95■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 CFAP52Q8N1V2 620 aa15.95■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 DUSP21Q9H596 190 aa15.95■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 REEP1Q9H902 201 aa15.95■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 TMEM39AQ9NV64 488 aa15.95■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 IMPAD1Q9NX62 359 aa15.95■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 OPN1SWP03999 348 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 CBLP22681 906 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 OR1E1P30953 314 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 IL12RB1P42701 662 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 OR2T5Q6IEZ7 315 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 PNCKQ6P2M8 343 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 OR2T29Q8NH02 315 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 ZNF675Q8TD23 568 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 GTF2H4Q92759 462 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 TMEM203Q969S6 136 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 AKR7A2O43488 359 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 SNX4O95219 450 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 CCNYL3P0C7X3 344 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 CKMT1AP12532 417 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 PKMP14618 531 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 UQCRC1P31930 480 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 ACVRL1P37023 503 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 KRT6CP48668 564 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 PURAQ00577 322 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 CPZQ66K79 652 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 PDFQ9HBH1 243 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 MUTYHQ9UIF7 546 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 MAU2Q9Y6X3 613 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 DOCK4Q8N1I0 1966 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 PCP4L1A6NKN8 68 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 ALX3O95076 343 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 GLUD1P00367 558 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 PPP3CCP48454 512 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 IL18R1Q13478 541 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 Q5BKY6 102 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 C1orf109Q9NX04 203 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 MEIOCA2RUB1 952 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 PTHP01270 115 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 S100A3P33764 101 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 RYKP34925 604 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 SLC19A1P41440 591 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 TTPAP49638 278 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 EFEMP1Q12805 493 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 SLC39A12Q504Y0 691 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 SLX4IPQ5VYV7 408 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 PIK3R3Q92569 461 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 MAP6Q96JE9 813 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 MGME1Q9BQP7 344 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 STMN3Q9NZ72 180 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 NUDT4Q9NZJ9 180 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 SATB2Q9UPW6 733 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 AP3M1Q9Y2T2 418 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 OR2A25A4D2G3 310 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 C2orf81A6NN90 581 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 M0R082 166 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 ARHGEF9O43307 516 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 TGFBR2P37173 567 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 CLCN4P51793 760 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 IRF3Q14653 427 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 KIAA0040Q15053 153 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 SIGIRRQ6IA17 410 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 GLCCI1Q86VQ1 547 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 KBTBD8Q8NFY9 601 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 BRI3BPQ8WY22 251 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 ZNF566Q969W8 418 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 C8orf48Q96LL4 319 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 EVPLLA8MZ36 301 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 ERVH48-1M5A8F1 160 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 AREL1O15033 823 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 TMCC2O75069 709 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 SCELO95171 688 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 TNFSF8P32971 234 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 P2RX3P56373 397 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 VLDLRP98155 873 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 CYP4F8P98187 520 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRP11-201ENST00000239367 ST3GAL4Q11206 333 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms