RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 IL17BQ9UHF5 180 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ZNF180Q9UJW8 692 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 SLC26A3P40879 764 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V0D1P61421 351 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 IRF9Q00978 393 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 TGFBIQ15582 683 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 LCTLQ6UWM7 567 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 DSELQ8IZU8 1212 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 OR4N4Q8N0Y3 316 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1191Q96A73 305 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 RHBDF1Q96CC6 855 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 MED8Q96G25 268 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 PADI1Q9ULC6 663 aa21.35■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 A0A0J9YVX5 310 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 H7BY64 318 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 CCNDBP1O95273 360 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 MT-ND3P03897 115 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 INHBAP08476 426 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 UCNP55089 124 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 TMPRSS3P57727 454 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 VSNL1P62760 191 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 RELAQ04206 551 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 VAC14Q08AM6 782 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 CCDC81Q6ZN84 652 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 RAPH1Q70E73 1250 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ATL1Q8WXF7 558 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 NXNL1Q96CM4 212 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 PRAP1Q96NZ9 151 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 GPR78Q96P69 363 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 OR2A5Q96R48 311 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 RUFY1Q96T51 708 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 PCBD2Q9H0N5 130 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 STARD5Q9NSY2 213 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 CROTQ9UKG9 612 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 SNX7Q9UNH6 387 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ACOT9Q9Y305 439 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 FITM1A5D6W6 292 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 MEN1O00255 615 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 TAPBPO15533 448 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 CAPN1P07384 714 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ANXA5P08758 320 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 CCND1P24385 295 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 MSH2P43246 934 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 CXADRP78310 365 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 PTCHD3Q3KNS1 767 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 RHBDD2Q6NTF9 364 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 TLDC1Q6P9B6 456 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 GPR135Q8IZ08 494 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 KCTD4Q8WVF5 259 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 SELENOSQ9BQE4 189 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 TMEM184CQ9NVA4 438 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 WDR70Q9NW82 654 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 A0A096LPK6 155 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 HAT1O14929 419 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 MED26O95402 600 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 CCNYL3P0C7X3 344 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A12P48065 614 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 SERPINB9P50453 376 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 CSNK1G2P78368 415 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 NAA25Q14CX7 972 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 WASHC2DQ5SRD0 308 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP40Q5TG30 622 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 ADGRD1Q6QNK2 874 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 PLD3Q8IV08 490 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 CT55Q8WUE5 264 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 ATOH8Q96SQ7 321 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 CHD6Q8TD26 2715 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 A0A087X1B8 175 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 H0YGG7 62 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 TFEBP19484 476 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 TYK2P29597 1187 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 GGT5P36269 586 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 DLSTP36957 453 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 GDF5P43026 501 aa21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms