RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 LCKP06239 509 aa21.49■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 NPRL3Q12980 569 aa21.49■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 VTCN1Q7Z7D3 282 aa21.49■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa21.49■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 ITPAQ9BY32 194 aa21.49■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 ARL15Q9NXU5 204 aa21.49■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 MCFD2Q8NI22 146 aa21.48■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 HSH2DQ96JZ2 352 aa21.48■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 ZIC5Q96T25 663 aa21.48■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 MMP27Q9H306 513 aa21.48■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 REEP1Q9H902 201 aa21.48■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 KIF17Q9P2E2 1029 aa21.48■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 PRPS1L1P21108 318 aa21.48■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 TUBA3EQ6PEY2 450 aa21.48■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 ARMC8Q8IUR7 673 aa21.48■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 TCAIMQ8N3R3 496 aa21.48■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 UBE2FQ969M7 185 aa21.48■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 RASSF1Q9NS23 344 aa21.48■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 NSG1P42857 185 aa21.47■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 SLC12A9Q9BXP2 914 aa21.47■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.46■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 EPYCQ99645 322 aa21.46■■□□□ 1.03
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