RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000189048.6

Tardbp-223, Transcript of TAR DNA-binding protein 43, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Tardbp, Length 1,096 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Serpinb3c	A2RSF9	386 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rabgap1l	A6H6A9	815 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cyp2b13	A6H6J2	491 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Krtap4-9	B1AQA9	244 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zfp839	E9PUU5	921 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cdh19	E9Q3A7	770 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tmem132b	F7BAB2	1078 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm10801	F7C7Q0	168 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Susd5	G3UW60	619 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Limk2	O54785	638 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Dnase1l3	O55070	310 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nmt1	O70310	496 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sp3	O70494	783 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Orc4	O88708	433 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gpi	P06745	558 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rpl7a	P12970	266 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gabrg2	P22723	474 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Itgal	P24063	1163 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Csta	P56567	97 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Exosc10	P56960	887 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pcsk1	P63239	753 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Fgf14	P70379	247 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rps3a	P97351	264 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pros1	Q08761	675 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Fut4	Q11127	433 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Vax1	Q2NKI2	338 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Garem1	Q3UFT3	876 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cd180	Q62192	661 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cyp4b1	Q64462	511 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tas2r115	Q7M719	310 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cct8l1	Q80YT3	562 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Atl1	Q8BH66	558 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ino80c	Q8BHA0	191 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ttc34	Q8C0Q3	554 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ska3	Q8C263	411 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Usp44	Q8C2S0	711 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Slc37a1	Q8R070	531 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Vps18	Q8R307	973 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Selenom	Q8VHC3	145 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nphs2	Q91X05	385 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zfp810	Q99K45	461 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Arl4d	Q99PE9	201 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ywhab	Q9CQV8	246 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zswim7	Q9CWQ2	152 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Lrrc17	Q9CXD9	443 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mrpl19	Q9D338	292 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Odf2l	Q9D478	642 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rrp8	Q9DB85	457 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sphk2	Q9JIA7	617 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Spag6	Q9JLI7	507 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ror2	Q9Z138	944 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zkscan5	Q9Z1D8	819 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Krtap12-1	Q9Z287	130 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Il18rap	Q9Z2B1	614 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Akap6	E9Q9K8	2307 aa		3.73	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Fam205a	A2APU8	1308 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Usp9x	P70398	2559 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mylk	Q6PDN3	1941 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tnxb	O35452	4006 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mtor	Q9JLN9	2549 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tmem235	B1AQL3	211 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ugt1a5	B2RT14	529 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm4175	D3YTW8	314 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm3594	E9Q2A7	267 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm20518	E9Q548	580 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm20878	L7N244	103 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Avil	O88398	819 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Aldoc	P05063	363 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Myl4	P09541	193 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Hoxa9	P09631	271 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Oas1a	P11928	367 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gja1	P23242	382 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rab20	P35295	233 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ret	P35546	1115 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rph3a	P47708	681 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ywhah	P68510	246 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048		Q0VG49	157 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ptcd3	Q14C51	685 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Spert	Q32MG2	446 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tmem64	Q3U145	381 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zbtb16	Q3UQ17	673 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Traf3	Q60803	567 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Papss1	Q60967	624 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ppp2r5c	Q60996	524 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Hsd3b5	Q61694	373 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ado	Q6PDY2	256 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Fastkd5	Q7TMV3	762 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Slitrk1	Q810C1	696 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Prima1	Q810F0	153 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Atpaf1	Q811I0	324 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Adam29	Q811Q4	763 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gpt2	Q8BGT5	522 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pced1b	Q8BGX1	433 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Klhl24	Q8BRG6	600 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Etnppl	Q8BWU8	499 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Atg16l1	Q8C0J2	607 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cabs1	Q8C633	391 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nemp2	Q8CB65	421 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pars2	Q8CFI5	475 aa		3.72	□□□□□ -1.81
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Trip10	Q8CJ53	603 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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