RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ermp1Q3UVK0 898 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Magee2Q52KG3 523 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm11992Q5SS90 291 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem199Q5SYH2 208 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BadQ61337 204 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fstl1Q62356 306 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1313Q7TQW8 311 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1152Q7TR34 310 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcolce2Q8R4W6 414 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sec16bQ91XT4 1051 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GatbQ99JT1 557 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp4f13Q99N19 523 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Apbb2Q9DBR4 760 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc19a2Q9EQN9 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cldn9Q9Z0S7 217 aa20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slfn9B1ARD6 910 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10324L7N208 604 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ugt2b17P17717 530 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ca8P28651 291 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ctnnb1Q02248 781 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ebf1Q07802 591 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q3UY34 256 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc185Q3V118 621 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc10a7Q5PT53 340 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp1r26Q6A025 1163 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Larp4bQ6A0A2 741 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp2r2bQ6ZWR4 443 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Efr3aQ8BG67 819 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Csgalnact1Q8BJQ9 530 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Elp6Q8BK75 266 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adipor2Q8BQS5 386 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Txndc11Q8K2W3 948 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Akr1c20Q8VC77 323 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdhr5Q8VHF2 831 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ugt2b38Q91WH2 530 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc17Q9CXD9 443 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 H2bfmQ9DAB5 224 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp6ap1Q9R1Q9 463 aa20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm4869A0A1B0GSG7 984 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tceal7A3KGA4 98 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klhl4B1AZR0 717 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Herc6F2Z461 1003 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01675 107 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01676 107 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01677 107 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01678 107 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mbl1P39039 239 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bcl6P41183 707 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stat6P52633 837 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GuloP58710 440 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tgm3Q08189 693 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdk15Q3V3A1 433 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ifi47Q61635 420 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Elmo1Q8BPU7 727 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gk5Q8BX05 534 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hmgcs1Q8JZK9 520 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc5a11Q8K0E3 673 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Asb9Q91ZT8 290 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MINDY3Q9CV28 444 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ist1Q9CX00 362 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcne2Q9D808 123 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NplQ9DCJ9 320 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ndufs3Q9DCT2 263 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ifi30Q9ESY9 248 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TescQ9JKL5 214 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lilra6A0A0B4J1F3 663 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Resp18P47939 175 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sat1P48026 171 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dsc1P55849 886 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Amigo2Q80ZD9 519 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rap2aQ80ZJ1 183 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GanabQ8BHN3 944 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem72Q8C3K5 275 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnajc27Q8CFP6 273 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1469Q8VFW5 309 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp1r16aQ923M0 524 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr6Q99ME2 1125 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Msh4Q99MT2 958 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lsm7Q9CQQ8 103 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Amdhd1Q9DBA8 426 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm13089A2AGW7 455 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mup6A2AV72 179 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4930595M18RikA2RRY9 829 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r4K7N784 913 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NagluO88325 739 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pebp1P70296 187 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rab33aP97950 237 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnal1Q05A62 190 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcgf5Q3UK78 256 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hdgfl2Q3UMU9 669 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Brinp2Q6DFY8 783 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ephx4Q6IE26 359 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Them6Q80ZW2 207 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pabpc5Q8C7D3 381 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbm4Q8C7Q4 361 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Irak2Q8CFA1 622 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf219Q8K2Y0 722 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbm4bQ8VE92 357 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MtapQ9CQ65 283 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mgme1Q9CXC3 338 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36 ms