RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641106.1

CASC19-211, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,184 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-211ENST00000641106 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 A0A0U1RQJ8 604 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 HACD1B0YJ81 288 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 CCL22O00626 93 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 PJA2O43164 708 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 ARHGAP6O43182 974 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 MTSS1O43312 755 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 RASSF9O75901 435 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 APOC2P02655 101 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 EBLN1P0CF75 366 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 PRSS56P0CW18 603 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 TCN2P20062 427 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 DLSTP36957 453 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 CCR10P46092 362 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 XRCC4Q13426 336 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 TUBB3Q13509 450 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 ITGA9Q13797 1035 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 IL11RAQ14626 422 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 METRNLQ641Q3 311 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 DAAM2Q86T65 1068 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 AMZ2Q86W34 360 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 RCOR2Q8IZ40 523 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 ACTL9Q8TC94 416 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 DLG3Q92796 817 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 CATSPER2Q96P56 530 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 WWP1Q9H0M0 922 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 BSNQ9UPA5 3926 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 OR5K3A6NET4 321 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 MGAT4DA6NG13 374 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 H3BS24 57 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 H7C0C1 242 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 KCNJ13O60928 360 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 DNAJB5O75953 348 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 SRP72O76094 671 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 APOL3O95236 402 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 LPLP06858 475 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 TPM1P09493 284 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 VCLP18206 1134 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 CTNNA2P26232 953 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 PTPN7P35236 360 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 CASRP41180 1078 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 ATP5OP48047 213 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 PRLHRP49683 370 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 GEMP55040 296 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 ABRQ12979 859 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 DNASE1L3Q13609 305 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 ERV3-1Q14264 604 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 SPARCL1Q14515 664 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 IGFBP7Q16270 282 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 BCL7AQ4VC05 210 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 ODF2Q5BJF6 829 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 KCTD11Q693B1 232 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 LCN10Q6JVE6 187 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 Q8N1Y9 231 aa6.94□□□□□ -1.3
CASC19-211ENST00000641106 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms