RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635550.1

SEC24C-207, Transcript of SEC24 homolog C, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC24C, Length 3,424 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24C-207ENST00000635550 GBX1Q14549 363 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 GALNT13Q8IUC8 556 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 HS6ST3Q8IZP7 471 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 CLECL1Q8IZS7 167 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 DDHD1Q8NEL9 900 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 SCAMP4Q969E2 229 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 UBE2FQ969M7 185 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 HHIPQ96QV1 700 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 HIST1H2AJQ99878 128 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 H2AFJQ9BTM1 129 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 RIBC2Q9H4K1 309 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 RMND5AQ9H871 391 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 IL1RAPQ9NPH3 570 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 CLIC1O00299 241 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 WNT9AO14904 365 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 CCNDBP1O95273 360 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 C1SP09871 688 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 PRPS2P11908 318 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 ENGP17813 658 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 RYKP34925 604 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 HALP42357 657 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 KIR3DL1P43629 444 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 MAPK8P45983 427 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 MAP2K4P45985 399 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 CLK3P49761 638 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 GABARAPL2P60520 117 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 PFN3P60673 137 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 ABHD18Q0P651 414 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 ATP1A4Q13733 1029 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 UGT8Q16880 541 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 FRG2Q64ET8 278 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 L3MBTL4Q8NA19 623 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 FIBINQ8TAL6 211 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 FAR1Q8WVX9 515 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 ECHDC3Q96DC8 303 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 CMTM7Q96FZ5 175 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 FRG2BQ96QU4 278 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 RAD21L1Q9H4I0 556 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 ERVK-18Q9QC07 812 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 BTBD3Q9Y2F9 522 aa7.15□□□□□ -1.26
SEC24C-207ENST00000635550 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 TOR1BO14657 336 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 FPGTO14772 594 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 SCN2BO60939 215 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 ANGPTL1O95841 491 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 OR56A5P0C7T3 313 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 IDUAP35475 653 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 OPRL1P41146 370 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 WNT3P56703 355 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 LSM3P62310 102 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 CHIT1Q13231 466 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 RAB33AQ14088 237 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 NR1D2Q14995 579 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 GGTA1PQ4G0N0 100 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 ZNF621Q6ZSS3 439 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 USP45Q70EL2 814 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 SERPINA11Q86U17 422 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 TCEAL8Q8IYN2 117 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 CHST14Q8NCH0 376 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 ABHD11Q8NFV4 315 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 CDC26Q8NHZ8 85 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 TMEM169Q96HH4 297 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 C19orf43Q9BQ61 176 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 BRD9Q9H8M2 597 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 ENPP5Q9UJA9 477 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 CCL26Q9Y258 94 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 COL4A6Q14031 1691 aa7.15□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 A0A1W2PRU2 124 aa7.14□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 OR2AG2A6NM03 316 aa7.14□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 GFYI3L273 518 aa7.14□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 TEX28O15482 410 aa7.14□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 NUDT7P0C024 238 aa7.14□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 IL1RNP18510 177 aa7.14□□□□□ -1.27
SEC24C-207ENST00000635550 PRPH2P23942 346 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms