RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 LAPTM4BQ86VI4 370 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 CNGA4Q8IV77 575 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAAF3Q8N9W5 541 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJB8Q8NHS0 232 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 HDAC10Q969S8 669 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM8Q9BZR9 551 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 TRPC4Q9UBN4 977 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 IDSB3KWA1 339 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 GAS8O95995 478 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 HEXBP07686 556 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 MYBL2P10244 700 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 P3H1Q32P28 736 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4N4Q8N0Y3 316 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6P1Q8NGX9 317 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 ENAMQ9NRM1 1142 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 PDZD2O15018 2839 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMD3O43242 534 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 NRP2O60462 931 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 GPC4O75487 556 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPN7P35236 360 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 BDKRB1P46663 353 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 ABHD17BQ5VST6 288 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 AADACL2Q6P093 401 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 XKRXQ6PP77 449 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT222Q8N1A0 295 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52K1Q8NGK4 314 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO7BQ6PIF6 2116 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP26.04■■□□□ 1.765e-9■□□□□ 8.4
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAMEF2O60811 474 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 SMSP52788 366 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 RWDD2BP57060 319 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 PMP22Q01453 160 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00523Q86TU6 105 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 OR13J1Q8NGT2 312 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 RAD51AP1Q96B01 352 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf90Q96M02 699 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 CARD6Q9BX69 1037 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 C14orf105Q9NVL8 296 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC14AQ9UNH5 594 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC19A2O60779 497 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGAMP11215 1152 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMA3P25788 255 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 LONRF1Q17RB8 773 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF44Q7L0R7 432 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2L3Q8NG85 312 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4L1Q8NH43 312 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGED4Q96JG8 741 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 CSMD2Q7Z408 3487 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT87PA6NCN2 255 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5H15A6NDH6 313 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 ANXA5P08758 320 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 SSTR2P30874 369 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 AP2B1P63010 937 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAMEP78395 509 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF33BQ06732 778 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 SPA17Q15506 151 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 C3AR1Q16581 482 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 NEK10Q6ZWH5 1172 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 TINAGQ9UJW2 476 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC168Q8NDH2 2452 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-217ENST00000629983 AOAHP28039 575 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ADORA2A-AS1P86434 159 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 CDH17Q12864 832 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 DSG2Q14126 1118 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 CCSMST1Q4G0I0 132 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 TSTD2Q5T7W7 516 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ACAT2Q9BWD1 397 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF32Q9H0A6 362 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 TEKT2Q9UIF3 430 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ANAPC5Q9UJX4 755 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 MRFAP1Q9Y605 127 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 NFS1Q9Y697 457 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM227AF5H4B4 570 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 SLCO2B1O94956 709 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 CMPK1P30085 196 aa26■■□□□ 1.75
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