RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 RMND5AQ9H871 391 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 FBXW2Q9UKT8 454 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 ELOVL7A1L3X0 281 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 ZNF860A6NHJ4 632 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 CYP7B1O75881 506 aa7.29□□□□□ -1.24
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PKP4-217ENST00000628904 CDKN2CP42773 168 aa7.29□□□□□ -1.24
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PKP4-217ENST00000628904 OR4A15Q8NGL6 344 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 XAGE5Q8WWM1 108 aa7.29□□□□□ -1.24
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PKP4-217ENST00000628904 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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PKP4-217ENST00000628904 ZNF510Q9Y2H8 683 aa7.29□□□□□ -1.24
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PKP4-217ENST00000628904 CACNA1GO43497 2377 aa7.29□□□□□ -1.24
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PKP4-217ENST00000628904 HID1Q8IV36 788 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 CATSPER1Q8NEC5 780 aa7.29□□□□□ -1.24
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PKP4-217ENST00000628904 MITFO75030 526 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 KAT7O95251 611 aa7.28□□□□□ -1.24
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PKP4-217ENST00000628904 TAS2R50P59544 299 aa7.28□□□□□ -1.24
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PKP4-217ENST00000628904 TRAF3Q13114 568 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 GSTA3Q16772 222 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 LIN52Q52LA3 116 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 ATAT1Q5SQI0 421 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.242e-7■■□□□ 14.2
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PKP4-217ENST00000628904 TMC8Q8IU68 726 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 TRIM48Q8IWZ4 208 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 ZNF555Q8NEP9 628 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 OR4E2Q8NGC2 313 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 RLN3Q8WXF3 142 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 THAP11Q96EK4 314 aa7.28□□□□□ -1.24
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PKP4-217ENST00000628904 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 H0Y8X5 98 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 CLIC1O00299 241 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 SLC28A1O00337 649 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 TNFAIP8O95379 198 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 ASGR2P07307 311 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 GSTM1P09488 218 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-217ENST00000628904 MAGP20916 626 aa7.28□□□□□ -1.24
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