RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 NSL1Q96IY1 281 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 FRG2BQ96QU4 278 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 ELOVL6Q9H5J4 265 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 TAC3Q9UHF0 121 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO4Q9UKT5 387 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0G2JNG1 304 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 KIR2DS3K7RE56 304 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC22A2O15244 555 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 PEX11AO75192 247 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP5HO75947 161 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF33BQ06732 778 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 KIR2DS5Q14953 304 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 ELOCQ15369 112 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SGO1Q5FBB7 561 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 LYSMD4Q5XG99 296 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 NAGSQ8N159 534 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR20Q8TBZ3 569 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFPM2Q8WW38 1151 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SELENOMQ8WWX9 145 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SH3KBP1Q96B97 665 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 EFCAB11Q9BUY7 163 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC40A1Q9NP59 571 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 TXLNGQ9NUQ3 528 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 MRGBPQ9NV56 204 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPN7Q9Y6W3 813 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 GON4LQ3T8J9 2241 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 LSM1O15116 133 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 RGS14O43566 566 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC2A4P14672 509 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SHMT2P34897 504 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SCTRP47872 440 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 C21orf59P57076 290 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 C6orf136Q5SQH8 315 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA19Q7Z5L4 167 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 PATE1Q8WXA2 126 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 ACAT2Q9BWD1 397 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 BDP1A6H8Y1 2624 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 MUC3AQ02505 3323 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP4BP51164 291 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 NEK2P51955 445 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 C17orf64Q86WR6 236 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 POT1Q9NUX5 634 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 CPNE7Q9UBL6 633 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 SPASTQ9UBP0 616 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PCM1Q15154 2024 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 HRO43593 1189 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 CDH1P12830 882 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 CALB2P22676 271 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMB5P28074 263 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 NCALDP61601 193 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.432e-14■■□□□ 13.1
CAPNS1-215ENST00000628018 ERVK-8P63133 956 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 YBX1P67809 324 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 LAPTM5Q13571 262 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 SQLEQ14534 574 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 NAA25Q14CX7 972 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 NR6A1Q15406 480 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PLK5Q496M5 336 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PAGE2BQ5JRK9 111 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 AMIGO1Q86WK6 493 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM48Q8IWZ4 208 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM46DQ8NEK8 389 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2A1Q8NGT9 310 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC37A2Q8TED4 501 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 LCN9Q8WX39 176 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP3R2Q96LZ3 170 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ACPTQ9BZG2 426 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PELI2Q9HAT8 420 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6C2Q9NZP2 312 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 TAGLN3Q9UI15 199 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 VIPP01282 170 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PIK3R1P27986 724 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 HMGCS1Q01581 520 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 TEAD4Q15561 434 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 SMU1Q2TAY7 513 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ICE2Q659A1 982 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 MED27Q6P2C8 311 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 GKN2Q86XP6 184 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM129CQ86XR2 697 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 SFTPA2Q8IWL1 248 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 OR7G3Q8NG95 312 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 LMX1AQ8TE12 382 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
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