RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	OLAH	Q9NV23	265 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PI4KA	P42356	2102 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	RHOBTB1	O94844	696 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	HMGN1	P05114	100 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV4-34	P06331	123 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CTSE	P14091	401 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	IDUA	P35475	653 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CASP3	P42574	277 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PGGT1B	P53609	377 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PGS1	Q32NB8	556 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PERM1	Q5SV97	790 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PMS2CL	Q68D20	193 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	HORMAD1	Q86X24	394 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	DLG3	Q92796	817 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	NANOG	Q9H9S0	305 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PKP3	Q9Y446	797 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PATJ	Q8NI35	1801 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1B0GTW7	788 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PQ72	361 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ISPD	A4D126	451 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	FPGT	O14772	594 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	TP73	O15350	636 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ENG	P17813	658 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ADRA1D	P25100	572 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	MGAT1	P26572	445 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CD38	P28907	300 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	HTR7	P34969	479 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGEA4	P43358	317 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PTK6	Q13882	451 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR107	Q5VW38	600 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	SNX31	Q8N9S9	440 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	FIG4	Q92562	907 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXJ1	Q92949	421 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF221	Q9UK13	617 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNK6	Q9Y257	313 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ACACB	O00763	2458 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CPED1	A4D0V7	1026 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM202	A6NGA9	273 aa		7.04	□□□□□ -1.28

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