RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 ARHGEF33A8MVX0 844 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 PHF2O75151 1096 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 MED26O95402 600 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 MLNP12872 115 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 CHRM3P20309 590 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 ITGA3P26006 1051 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 CMPK1P30085 196 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 OR1D4P47884 311 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 YBX1P67809 324 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 CCZ1BP86790 482 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 GPS1Q13098 491 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 ARHGAP19Q14CB8 494 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 PRTGQ2VWP7 1150 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 KLHL38Q2WGJ6 581 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 ACSBG2Q5FVE4 666 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 NEPROQ6NW34 567 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 PRMT9Q6P2P2 845 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 FBXO42Q6P3S6 717 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 TTC27Q6P3X3 843 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 NEK10Q6ZWH5 1172 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 OR4N4Q8N0Y3 316 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 RASGEF1CQ8N431 466 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 DTWD1Q8N5C7 304 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 SMPDL3AQ92484 453 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 ZNF304Q9HCX3 659 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 ASF1BQ9NVP2 202 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-206ENST00000588345 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 MAGEB16A2A368 324 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CBX6O95503 412 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 RNF224P0DH78 156 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 HSD17B2P37059 387 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CLCN7P51798 805 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 EMP3P54852 163 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 TUBB8Q3ZCM7 444 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD22Q5VYY1 191 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CUZD1Q86UP6 607 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 MCUQ8NE86 351 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 OR11G2Q8NGC1 345 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 PPP4R1Q8TF05 950 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 FAM136AQ96C01 138 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 VPS50Q96JG6 964 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 C10orf90Q96M02 699 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 DPH7Q9BTV6 452 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 FAM114A2Q9NRY5 505 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 MAP10Q9P2G4 905 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 KLHL42Q9P2K6 505 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 MED16Q9Y2X0 877 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 MAU2Q9Y6X3 613 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 E5RI56 91 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ALOX12BO75342 701 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 KRT14P02533 472 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CARSP49589 748 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 VPS41P49754 854 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 RBBP7Q16576 425 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 MUM1Q2TAK8 710 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 SUSD1Q6UWL2 747 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 STT3BQ8TCJ2 826 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 PLCD4Q9BRC7 762 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ACAT2Q9BWD1 397 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 SAMD15Q9P1V8 674 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 NEU2Q9Y3R4 380 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 SDR42E2A6NKP2 422 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 H0YGG7 62 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 VPS26AO75436 327 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 USP1O94782 785 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 DDAH2O95865 285 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CATP04040 527 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 MAGEA3P43357 314 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 TERF1P54274 439 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 PNLIPRP1P54315 467 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 KLC1Q07866 573 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 NR6A1Q15406 480 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 CYP1B1Q16678 543 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-206ENST00000588345 TTLL9Q3SXZ7 439 aa17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms