RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568104.5

BBS2-218, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene BBS2, Length 2,623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2-218ENST00000568104 MTAPQ13126 283 aa15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 POM121L1PQ3SYA9 428 aa15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 DOK6Q6PKX4 331 aa15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 WDR20Q8TBZ3 569 aa15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 CCDC138Q96M89 665 aa15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 ZSWIM3Q96MP5 696 aa15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 VPS35Q96QK1 796 aa15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 ING2Q9H160 280 aa15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 IL23AQ9NPF7 189 aa15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 USE1Q9NZ43 259 aa15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 DKK3Q9UBP4 350 aa15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa15.96■□□□□ 0.15
BBS2-218ENST00000568104 A0A1B0GVG6 124 aa15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 SOBPA7XYQ1 873 aa15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 E7EQ34 232 aa15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 YAP1P46937 504 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 CTSCP53634 463 aa15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 NTHL1P78549 312 aa15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 PPP2R2BQ00005 443 aa15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 DUOXA1Q1HG43 343 aa15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 TTC23Q5W5X9 447 aa15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 AGTRAPQ6RW13 159 aa15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 GLMNQ92990 594 aa15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 GLYATL1Q969I3 302 aa15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 ISOC1Q96CN7 298 aa15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 DTNBP1Q96EV8 351 aa15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 MED8Q96G25 268 aa15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 PYURFQ96I23 114 aa15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 LRIG1Q96JA1 1093 aa15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 EVPLLA8MZ36 301 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 NOBOXO60393 691 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 PRMT3O60678 531 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 ELFN1P0C7U0 828 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 ELK4P28324 431 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 TTKP33981 857 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 SHMT2P34897 504 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 PREPP48147 710 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 TRPC1P48995 793 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 VAC14Q08AM6 782 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 PMS2P3Q13401 168 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 NAE1Q13564 534 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 DOC2AQ14183 400 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 SPESP1Q6UW49 350 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 KCTD8Q6ZWB6 473 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 RTL10Q7L3V2 364 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 EID3Q8N140 333 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 OR7A2PQ8NGA2 310 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 PANX1Q96RD7 426 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 CCM2Q9BSQ5 444 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 FAM118AQ9NWS6 357 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 FPGTO14772 594 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 CATP04040 527 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 MMP12P39900 470 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 PRLHRP49683 370 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 ACOX1Q15067 660 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 CES5AQ6NT32 575 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 ERAP2Q6P179 960 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 THAP5Q7Z6K1 395 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 SERPINA11Q86U17 422 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 HS3ST5Q8IZT8 346 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 ZNF555Q8NEP9 628 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 PJA1Q8NG27 643 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 OR5K1Q8NHB7 308 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 HCAR2Q8TDS4 363 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 AP2M1Q96CW1 435 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 CXorf21Q9HAI6 301 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 EBF1Q9UH73 591 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 E2F6O75461 281 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 CCNDBP1O95273 360 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 HNF4AP41235 474 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 SLC14A1Q13336 389 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 UGT8Q16880 541 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 GRHL2Q6ISB3 625 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 LIPIQ6XZB0 460 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 FOXJ1Q92949 421 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 SLC5A10A0PJK1 596 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 H0YIV9 168 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-218ENST00000568104 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms