RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566336.5

NAE1-215, Transcript of NEDD8 activating enzyme E1 subunit 1, human

TSL 5

Gene NAE1, Length 686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NAE1-215	ENST00000566336	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	GPBP1	Q86WP2	473 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	PKP2	Q99959	881 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	UCK1	Q9HA47	277 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	CAD	P27708	2225 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	DSCAM	O60469	2012 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	SCN2A	Q99250	2005 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336		A0A087WV62	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	SYT5	O00445	386 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	AQP7	O14520	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	TBX1	O43435	398 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	DLX3	O60479	287 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	USP1	O94782	785 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	ADCY5	O95622	1261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	VIP	P01282	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	IVL	P07476	585 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	HBQ1	P09105	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	ITGA2	P17301	1181 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	CYP2A7	P20853	494 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	TNFSF4	P23510	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	MMP11	P24347	488 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	PEX2	P28328	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	PRIM2	P49643	509 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	RAD51	Q06609	339 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	D2HGDH	Q8N465	521 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	AMER3	Q8N944	861 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	BVES	Q8NE79	360 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	PLIN2	Q99541	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	RAB33B	Q9H082	229 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	ALG6	Q9Y672	507 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336		A0A0D9SEW6	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336		A0A1W2PPR1	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	OR5H15	A6NDH6	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	KPNA5	O15131	536 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	VEGFD	O43915	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	WDPCP	O95876	746 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	GSR	P00390	522 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	UMOD	P07911	640 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NAE1-215	ENST00000566336	PEPD	P12955	493 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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