RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 FUT8Q9BYC5 575 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 NLNQ9BYT8 704 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 DERL2Q9GZP9 239 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ACSS3Q9H6R3 686 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 EURLQ9NYK6 297 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PDE10AQ9Y233 779 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PADI2Q9Y2J8 665 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM208BQ5VWN6 2430 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A1W2PPV9 198 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TSPAN12O95859 305 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ITGB2P05107 769 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 INHBAP08476 426 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CNTFP26441 200 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 DLSTP36957 453 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SERPINB9P50453 376 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CDKL4Q5MAI5 379 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 LGSNQ5TDP6 509 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RHBDD2Q6NTF9 364 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 AGTRAPQ6RW13 159 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MR1Q95460 341 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 FBXL8Q96CD0 374 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MED8Q96G25 268 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SELENOSQ9BQE4 189 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 KLHL25Q9H0H3 589 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SMYD2Q9NRG4 433 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ENAMQ9NRM1 1142 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 NINJ2Q9NZG7 142 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TAC3Q9UHF0 121 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 OARD1Q9Y530 152 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ERVH48-1M5A8F1 160 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MEN1O00255 615 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF749O43361 778 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 KRT38O76015 456 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 S100BP04271 92 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 NTRK1P04629 796 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RAB40ALP0C0E4 278 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RHOXF2BP0C7M4 288 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 LIFP15018 202 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF28P17035 718 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TCN2P20062 427 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TBPL1P62380 186 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SUSD1Q6UWL2 747 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 LCTLQ6UWM7 567 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RNF44Q7L0R7 432 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 VASH2Q86V25 355 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 C17orf64Q86WR6 236 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 DSELQ8IZU8 1212 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 THAP11Q96EK4 314 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 WBP1Q96G27 269 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 NRTNQ99748 197 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 EGFL8Q99944 293 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RHOXF2Q9BQY4 288 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PLCD4Q9BRC7 762 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 DPH7Q9BTV6 452 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 DHRS4Q9BTZ2 278 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ACAT2Q9BWD1 397 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CPNE5Q9HCH3 593 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM60AQ9NP50 221 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM184CQ9NVA4 438 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CROTQ9UKG9 612 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TLK1Q9UKI8 766 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A087X1B8 175 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 OR2A25A4D2G3 310 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 IPO13O94829 963 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TIAF1O95411 115 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ABHD2P08910 425 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 GABRA4P48169 554 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 EMP3P54852 163 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 DNASE1L3Q13609 305 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZIC1Q15915 447 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 FCRL6Q6DN72 434 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ADCK2Q7Z695 626 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms