RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 CLDN1O95832 211 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 HPP00738 406 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 ERVK-10P10266 1014 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 ACPPP15309 386 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 CXCR2P25025 360 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 FMO4P31512 558 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 DCTP40126 519 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 PER3P56645 1201 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 CRADDP78560 199 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 SARNPP82979 210 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 CDK16Q00536 496 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 KLC1Q07866 573 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 MUM1Q2TAK8 710 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 ATG9BQ674R7 924 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 ZNF787Q6DD87 383 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 FRMPD2BQ6IN97 320 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 FBXO42Q6P3S6 717 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 CNSTQ6PJW8 725 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 COX15Q7KZN9 410 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 PRSS58Q8IYP2 241 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 OR4N4Q8N0Y3 316 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 OR2A1Q8NGT9 310 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 STT3BQ8TCJ2 826 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 GRHL3Q8TE85 626 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 FAR1Q8WVX9 515 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 MAIP1Q8WWC4 291 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 SMPDL3AQ92484 453 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 DPH7Q9BTV6 452 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 CRB3Q9BUF7 120 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 TREX1Q9NSU2 369 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 SPATA7Q9P0W8 599 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 C3orf18Q9UK00 162 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 OSGIN2Q9Y236 505 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 NTNG1Q9Y2I2 539 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 CREBBPQ92793 2442 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.79□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 DYTNA2CJ06 578 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 ENO4A6NNW6 628 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 TXNDC9O14530 226 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 MAP2K7O14733 419 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 LRRTM2O43300 516 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 PHF2O75151 1096 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 VPS26AO75436 327 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 USP1O94782 785 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 ESR1P03372 595 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 MYBL2P10244 700 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 EDN3P14138 238 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 PKMP14618 531 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 FBLP22087 321 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 PSMB5P28074 263 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 NMBRP28336 390 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 ATP5DP30049 168 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 HSD17B2P37059 387 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 BDKRB1P46663 353 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 EMP2P54851 167 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 MFAP5Q13361 173 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 LINC00696Q6ZRV3 163 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 NDUFAF7Q7L592 441 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 SPC24Q8NBT2 197 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 OR1N1Q8NGS0 311 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 MFSD3Q96ES6 412 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 CABS1Q96KC9 395 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 BIRC8Q96P09 236 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 KIFC1Q9BW19 673 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 ACAT2Q9BWD1 397 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 ZNF160Q9HCG1 818 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 HOMER3Q9NSC5 361 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 CSAG2Q9Y5P2 127 aa7.78□□□□□ -1.16
COCH-211ENST00000557065 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.77□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms