RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554666.5

PAPOLA-209, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-209	ENST00000554666	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	SERINC4	A6NH21	518 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	TEX28	O15482	410 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	LHCGR	P22888	699 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	CSRP3	P50461	194 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	ASCL1	P50553	236 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	CSNK2B	P67870	215 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	MYL7	Q01449	175 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	TAB1	Q15750	504 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	MMD2	Q8IY49	270 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666		Q8N377	158 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	LRRC15	Q8TF66	581 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	CENPT	Q96BT3	561 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	MOB3A	Q96BX8	217 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	SPAG5	Q96R06	1193 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	TLE6	Q9H808	572 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666		A0A1W2PR80	420 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	GJB3	O75712	270 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	C22orf31	O95567	290 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	IGHE	P01854	428 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	SMIM18	P0DKX4	95 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	PRKAR1A	P10644	381 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	IRF2	P14316	349 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	JAK1	P23458	1154 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	PTPN3	P26045	913 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	PIK3R1	P27986	724 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	LIG4	P49917	911 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	GCNT1	Q02742	428 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	CUL3	Q13618	768 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	ENPP2	Q13822	863 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	LGI2	Q8N0V4	545 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666		Q8NBF4	154 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	PTER	Q96BW5	349 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	AGAP4	Q96P64	663 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	DGAT2	Q96PD7	388 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666		Q9H8V8	135 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	PDE7B	Q9NP56	450 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	PTGES	O14684	152 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	PGM3	O95394	542 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	MPZ	P25189	248 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	VAMP7	P51809	220 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	PSMC6	P62333	389 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	PAX8	Q06710	450 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	PRKG2	Q13237	762 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	SGCG	Q13326	291 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	PTPRCAP	Q14761	206 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	ZNF774	Q6NX45	483 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	PIGB	Q92521	554 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	LGMN	Q99538	433 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAPOLA-209	ENST00000554666		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
PAPOLA-209	ENST00000554666	ASB14	A6NK59	587 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAPOLA-209	ENST00000554666	BEST1	O76090	585 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAPOLA-209	ENST00000554666	DDHD2	O94830	711 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAPOLA-209	ENST00000554666	IGHV3-13	P01766	116 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAPOLA-209	ENST00000554666	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
PAPOLA-209	ENST00000554666	DNASE1	P24855	282 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAPOLA-209	ENST00000554666	CASP2	P42575	452 aa		3.4	□□□□□ -1.87

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