RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 IGHEP01854 428 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PROCP04070 461 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MPOP05164 745 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM6P0DI80 62 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DRD1P21728 446 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NR4A2P43354 598 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TTPAP49638 278 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HNMTP50135 292 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC3A1Q07837 685 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SCGB2A2Q13296 93 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GPR17Q13304 367 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PAGE2Q7Z2X7 111 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MTURNQ8N3F0 131 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 COQ8AQ8NI60 647 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AP2M1Q96CW1 435 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RANBP9Q96S59 729 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 P2RY13Q9BPV8 354 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CTDNEP1O95476 244 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 JCHAINP01591 159 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ITGA8P53708 1063 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZACNQ401N2 412 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OTOAQ7RTW8 1153 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TMC8Q8IU68 726 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SETD6Q8TBK2 473 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GPR152Q8TDT2 470 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SNAPC3Q92966 411 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OR2M4Q96R27 311 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TAS2R13Q9NYV9 303 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ASB4Q9Y574 426 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CPQQ9Y646 472 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 H3BSA7 217 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TNFP01375 233 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CHRNA1P02708 482 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FGFR1P11362 822 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PPP3CBP16298 524 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 L1CAMP32004 1257 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CXCL12P48061 93 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PNLIPRP1P54315 467 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PMPCAQ10713 525 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 POU6F1Q14863 301 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NR1I3Q14994 352 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CDNFQ49AH0 187 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DHFR2Q86XF0 187 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DTX3Q8N9I9 347 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CEP76Q8TAP6 659 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLX1AQ9BQ83 275 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PKIBQ9C010 78 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 EBF3Q9H4W6 596 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TDP1Q9NUW8 608 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RNF112Q9ULX5 631 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CIB4A0PJX0 185 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ALG1L2C9J202 215 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MDM4O15151 490 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HRGP04196 525 aa6.16□□□□□ -1.42
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