RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 UNC50Q53HI1 259 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ICE2Q659A1 982 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ATG9BQ674R7 924 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CYB5D1Q6P9G0 228 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 MILR1Q7Z6M3 343 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CLYBLQ8N0X4 340 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 KRT78Q8N1N4 520 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TEX9Q8N6V9 391 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TTLQ8NG68 377 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 WDR34Q96EX3 536 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TMEM79Q9BSE2 394 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 MECRQ9BV79 373 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SLC29A3Q9BZD2 475 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 NT5DC2Q9H857 520 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ACTR8Q9H981 624 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 VTI1BQ9UEU0 232 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 HAO1Q9UJM8 370 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ADAM21Q9UKJ8 722 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 KLK4Q9Y5K2 254 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 RNF215Q9Y6U7 377 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GSAPA4D1B5 854 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 OR6C74A6NCV1 312 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TRPC5OSA6NMA1 111 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TNFSF14O43557 240 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TGDSO95455 350 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CPNE6O95741 557 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 KRT6AP02538 564 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 KRT6BP04259 564 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 UROSP10746 265 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SDHBP21912 280 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ACP1P24666 158 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 KRT6CP48668 564 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 RPL14P50914 215 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 IRF8Q02556 426 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 E2F2Q14209 437 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CCDC6Q16204 474 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SPESP1Q6UW49 350 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 RNF165Q6ZSG1 346 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 KMT5CQ86Y97 462 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 L3MBTL4Q8NA19 623 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ABHD11Q8NFV4 315 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 OR2A1Q8NGT9 310 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PATE1Q8WXA2 126 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TCEAL3Q969E4 200 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 THAP11Q96EK4 314 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CHMP6Q96FZ7 201 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 AIF1LQ9BQI0 150 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PITPNM3Q9BZ71 974 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GSTO2Q9H4Y5 243 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 MID1IP1Q9NPA3 183 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 FSCN3Q9NQT6 498 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 NMRK1Q9NWW6 199 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PSD3Q9NYI0 1048 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ACTR10Q9NZ32 417 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SNX6Q9UNH7 406 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 A0A0J9YY10 115 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CPED1A4D0V7 1026 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GMNCA6NCL1 334 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TLCD2A6NGC4 264 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TCP11X1B4DZS4 312 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 H0YIV9 168 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 BTN3A3O00478 584 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TXNDC9O14530 226 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 VPS4BO75351 444 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 WFS1O76024 890 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 VIMP08670 466 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CD59P13987 128 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms