RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM196Q5HYL7 178 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM31Q5JXX7 168 aa20.28■□□□□ 0.84
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PRDM4-205ENST00000550376 TGFB1P01137 390 aa20.24■□□□□ 0.83
PRDM4-205ENST00000550376 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PRDM4-205ENST00000550376 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
PRDM4-205ENST00000550376 GRHL2Q6ISB3 625 aa20.24■□□□□ 0.83
PRDM4-205ENST00000550376 FIG4Q92562 907 aa20.24■□□□□ 0.83
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PRDM4-205ENST00000550376 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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