RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 PENKP01210 267 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 GSSP48637 474 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 SMSP52788 366 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 CAPZA1P52907 286 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ATP1A4Q13733 1029 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 DGCR6Q14129 220 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 MEDAGQ5VYS4 303 aa8.29□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 CD244Q9BZW8 370 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.29□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.29□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 CHRNA6Q15825 494 aa8.29□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 OR8J3Q8NGG0 315 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 TIPRLO75663 272 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ATP6AP2O75787 350 aa8.28□□□□□ -1.08
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